12
12
Ostatnia odsłona „Kości” zaczyna się od momentu, w którym urwał się poprzedni sezon. Brennan została porwana przez byłego asystenta Zacka Addy'ego, a Booth i reszta zespołu rusza na jej poszukiwania. Uratowanie bohaterki jest jednak dopiero początkiem ich problemów.
Znalezione zostaje ciało mężczyzny, który zajmował się tworzeniem botów. Ekipa musi stwierdzić, czy sztuczna inteligencja, będąca jego dziełem, została zaprogramowana, by go zabić. Tymczasem Bones szykuje specjalną niespodziankę dla wszystkich z okazji swoich czterdziestych urodzin.
Kiedy ciało staruszka zostaje odkryte na składowisku odpadów chemicznych, śledczy poznają dramat, jaki dotyka pensjonariuszy domu spokojnej starości. Praca nad sprawą prowokuje ich do rozmów o małżeństwie i dzieciach.
Zespół bada przypadek morderstwa osoby z przeszłości Bootha i Brennan. Tymczasem Aubrey staje przed dylematem moralnym, kiedy powraca jego ojciec.
Ginie korepetytor bogatych studentów. Ekipa przesłuchuje potencjalnych sprawców: od zawiedzionych rodziców po współlokatora ofiary, mającego przeszłość kryminalną. Tymczasem Bones jest niezadowolona z głosu, czytającego jej książkę i próbuje udowodnić, że mogłaby sama nagrać audiobook.
Poćwiartowane ciało mistrzyni golfowej, która została drwalką, prowadzi śledczych do świata zawodów w rąbaniu drewna. Booth i Brennan odkrywają szereg tajemnic, które mogły doprowadzić do zabójstwa, w tym zdradę małżeńską. Tymczasem Hodgins analizuje bakterie na kości jednej z dawnych ofiar, wierząc że doprowadzi do oczyszczenia z zarzutów Zacka Addy'ego.
Kilka ciał związanych z dawnym oddziałem wojskowym Bootha pojawia się w okolicach Waszyngtonu. Bohater musi sięgnąć do swojej przeszłości i znaleźć zabójcę, zanim ten dopadnie jego. Ojciec ukrywa przed Brennan poważną operację, co zmusza ją do refleksji na temat zaufania i śmiertelności oraz zagrożeń, jakie płyną dla jej rodziny.
Niedawna strata powoduje, że Booth i Brennan oddalają się od siebie, różnie przeżywając żałobę. Tymczasem z wizytą wpada dawny ukochany bohaterki.
Kiedy młody mężczyzna ginie w strasznym wypadku w prasie do siana, Booth, Brennan i Aubrey wcielają się w ludzi ze świata wyścigów starych samochodów, żeby odkryć prawdę. Tymczasem doktor Gordon Wyatt powraca i pomaga Hodginsowi i Cam, gdy śledztwo w sprawie Gormogona utyka w ślepej uliczce.
Pełne oparzeń i stłuczeń ciało początkującego reżysera spada na przejeżdżający samochód. Zespół odwiedza dziwne lokalizacje i postacie, związane z jego filmem. Bones radzi się doktor Mayer na temat znaczenia pasji w pracy zawodowej. Booth pozwala Aubreyowi przejąć prowadzenie aktualnej sprawy.
Wątki głównych bohaterów zmierzają ku rozwiązaniu. Brennan zeznaje podczas procesu Zacka, Angela ma ważną nowinę, a Aubrey i Jessica podejmują decyzję na temat wspólnej przyszłości. Jednocześnie zespół dowiaduje się o ucieczce Kovaca. Booth stara się chronić siebie i swoich najbliższych przed najgroźniejszym z dotychczasowych planów mordercy.
Kovac wciąż pozostaje nieuchwytny, a zespół instytutu próbuje go namierzyć. Po tym, jak Brennan wpada w kłopoty, reszta ekipy musi znaleźć zabójcę bez niej, wykorzystując wszystko, czego ich nauczyła. Kiedy wszystko wskazuje na to, że ktoś z zewnątrz zapewnia Kovacowi pomoc oraz kryjówkę, Booth i Brennan ruszają w pościg za nim.
Pół roku po wydarzeniach ostatniego sezonu Booth, Brennan, Christine oraz jej nowy braciszek wiodą pozornie wymarzone życie z dala od przeszłości pełnej przypadków morderstw. Jednakże sprawa, z którą małżeństwo jest osobiście związane, skłania Brennan do zaangażowania się w badanie szczątków ofiary. Booth znika w tajemniczych okolicznościach, co doprowadza do rozpoczęcia śledztwa przez FBI.
Zniknięcie Bootha robi się jeszcze bardziej zagadkowe. Ekipa odkrywa, że agentka FBI Miller ukrywała przed nimi kluczowe informacje, które mogły doprowadzić do odkrycia miejsca pobytu kolegi.
Brennan i Booth wracają na swoje stanowiska w Instytucie Jeffersona i FBI. Zwłoki znalezione w gospodarstwie rybnym stają się przedmiotem śledztwa. Okazuje się, że ktoś pobrał narządy wewnętrzne ofiary przed wrzuceniem ciała do wody.
W lesie zostają odkryte szczątki agenta nieruchomości, zjedzone przez zwierzęta, będące hybrydą wilka i kojota. Brennan prosi o pomoc w śledztwie genialną antropolożkę doktor Beth Mayer (w tej roli gościnnie Betty White).
Instytut Jeffersona obchodzi Halloween. Ekipę odwiedza niespodziewanie świeżo mianowana agentka FBI Abbie Mills oraz Ichabod Crane, który przyjechał po ciało bez głowy, badane przez Brennan i jej kolegów. Czwórka bohaterów musi wspólnie pracować nad odkryciem, do kogo należą dwustuletnie bezgłowe szczątki i jaki mają związek z ofiarą współczesnego zabójstwa.
Zmasakrowane zwłoki senatora zostają znalezione w ulicznej zamiatarce. Brennan, Booth i reszta zespołu udają się na Kapitol, żeby rozwikłać zagadkę politycznego morderstwa.
Ekipa bada sprawę zabójstwa iluzjonisty, specjalizującego się w spektakularnych ucieczkach, którego ciało odkryto w lesie. Okazuje się, że był on zaangażowany w potajemne przedsięwzięcia, które mogły przysporzyć mu wrogów w społeczności magików.
Dziennikarz polityczny zostaje znaleziony martwy po opublikowaniu artykułu na temat korupcji w Narodowej Agencji Bezpieczeństwa. Paranoja Hodginsa udziela się całemu zespołowi, kiedy zdają sobie sprawę, że każdy ich ruch jest obserwowany. Tymczasem Brennan szykuje niespodziankę dla Bootha, a ekipa obchodzi wspólnie Święto Dziękczynienia.
Aby rozwiązać sprawę morderstwa, Brennan i Booth biorą udział w konkursie strzeleckim w stylu Dzikiego Zachodu.
Zespół bada przypadek zabójstwa funkcjonariusza policji, które wstrząsa zarówno Instytutem Jeffersona, jak też kadrą FBI.
Hodgins od dwóch miesięcy przechodzi rehabilitację, ale paraliż zmusza go do poruszania się na wózku. Tymczasem Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie śmierci adwokatki z urzędu, której wielu dawnych klientów miało motyw, by ją zabić.
Zespół prowadzi sprawę działacza na rzecz praw mężczyzn, który zginął w wypadku samochodowym. Zwykle spokojna Brennan traci panowanie nad sobą podczas przesłuchania i uderza współzałożyciela organizacji, do której należał zabity. Angela i reszta zespołu próbują ułożyć sobie relacje ze zgorzkniałym przez swoje inwalidztwo Hodginsem. Booth podejrzewa, że Brennan przynosi pecha filadelfijskiej drużynie hokejowej.
W parku zostają znalezione rozkładające się zwłoki pracownicy socjalnej. Dowody wskazują, że zabójca mieszkał razem z ciałem przez wiele miesięcy, zanim się go pozbył.
Instytut Jeffersona bada przypadek zabójstwa więźniarki, która zniknęła po przeniesieniu do ośrodka resocjalizacji. Podejrzany w sprawie ma powiązania z Boothem. Tymczasem Brennan grozi zawieszenie w obowiązkach służbowych po jej napaści na przesłuchiwanego w poprzedniej sprawie.
Zamarznięte ciało prywatnego detektywa zostaje znalezione w rzece Potomac. Ofiara zajmowała się wyciszaniem spraw kryminalnych i uwalnianiem swoich klientów od problemów z prawem. Tymczasem Aubrey jest zaskoczony, kiedy dowiaduje się o miejscu pobytu ojca. Angela i Hodgins nadal pracują nad swoim burzliwym związkiem, a Brennan i Booth otrzymują pierwsze zestawienie ocen córki.
Zespół bada przypadek śmierci lidera uniwersyteckiej grupy wokalnej, którego ciało zostało znalezione w szkolnym laboratorium ze szczurami. Przy okazji na jaw wychodzą zaskakujące informacje na temat doświadczeń Aubreya ze studiów. Hodgins zgłasza się do udziału w eksperymentalnym badaniu, dotyczącym regeneracji nerwów, Booth planuje letnią wyprawę z Parkerem, a do instytutu dołącza nowy stażysta.
Pijany student natrafia na ciało agenta służb specjalnych tuż przed wizytą prezydenta w okolicy. Śledczy wpadają na trop szokujących dowodów, które podnoszą wagę sprawy na poziom państwowy i wymagają od Bootha dania z siebie wszystkiego. Brennan jest chora na grypę, ale nie zamierza rezygnować z udziału w kluczowych decyzjach.
Ekipa dokumentalistów podąża za Brennan, Boothem i resztą zespołu podczas rutynowego postępowania w sprawie zwłok pogrzebanych na wysypisku śmieci ponad dekadę temu.
Instytut Jeffersona prowadzi sprawę śmierci zawodowego hokeisty, którego bezgłowe ciało zostało wrzucone do rzeki. Dogłębna znajomość tej dyscypliny pomaga Boothowi rozwiązać zagadkę i zmierzyć się na lodzie z rywalem z przeszłości. Tymczasem Hodgins i Oliver ścigają się, kto pierwszy znajdzie głowę ofiary, a Booth i Brennan postanawiają pozbyć się z domu zbędnych gratów.
Szczątki słynnego miliardera i odkrywcy Henry'ego Charlesa zostają znalezione na Antarktydzie. Tak ważne śledztwo zostaje przekazane Brennan i Boothowi, którzy mają stwierdzić, czy śmierć była zabójstwem.
Zespół bada sprawę ciała znalezionego w zakładzie przetwarzania szkła. W szczęce denatki ukryty był diament. Inspektor Rousseau z Francji zgłasza się do śledczych z informacją obciążającą męża ofiary.
Ekipa wraca do dawnego śledztwa, dotyczącego seryjnego zabójcy nazywanego lalkarzem, który żył z ciałami ofiar, zanim je porzucił. Tymczasem Brennan czuje się winna, że przez jej odejście z pracy nie udało się powstrzymać przestępcy rok wcześniej.
Booth przebywa w areszcie, oczekując na proces. Członkowie zespołu z Instytutu Jeffersona zastanawiają się, czy szczątki zmarłego przed 16 laty mężczyzny mogą mieć coś wspólnego ze spiskiem, w wyniku którego ich przyjaciel trafił do więzienia. Tymczasem Sweets i Daisy dzielą się niespodzianką z pracownikami laboratorium.
Agent Aubrey pomaga członkom zespołu w poszukiwaniach, których celem jest ujawnienie trwającego od wielu dziesięcioleci rządowego spisku oraz ustalenie, kto wrobił Bootha w morderstwo. Sprawa przybiera niespodziewany obrót wraz z odkryciem materiału dowodowego w postaci DNA, mającego powiązania z pewnym skandalem.
W kanale burzowym znalezione zostają szczątki konserwatywnego gospodarza programu radiowego. Śledztwo ujawnia pewne zaskakujące aktywności zmarłego, co pozwala zawęzić krąg podejrzanych. Tymczasem agent Aubrey stara się zdobyć zaufanie Bootha. Brennan martwi się o stan psychiczny swojego męża.
Dochodzenie w sprawie zamordowania programisty gier wideo ujawnia majątek, który ofiara zgromadziła podczas swojej kariery zawodowej. Z tego powodu podejrzenia padają na wszystkie osoby z najbliższego otoczenia zmarłego. Tymczasem stażystka Jessica mówi swoim kolegom o pewnej inicjatywie edukacyjnej, w którą jest zaangażowana. Brennan i Booth rozmawiają na temat przyszłości Christine.
Brennan wygłasza wykład podczas konferencji dla kryminologów. Po tym, jak na klatce schodowej odkryte zostają ludzkie zwłoki, wszyscy uczestnicy zgromadzenia oferują swoją pomoc w przeprowadzeniu śledztwa. Członkowie zespołu z Instytutu Jeffersona nie mogą ukryć zaskoczenia, gdy okazuje się, że Hodgins staje się podejrzanym o morderstwo. Tymczasem Brennan spotyka swojego rywala, a Wendell wraca do pracy, z nowymi informacjami na temat stanu swojego zdrowia.
Na skraju drogi znalezione zostają szczątki zamordowanej pokojówki. Podejrzanym staje się jej zamożny, były pracodawca. W śledztwie dochodzi jednak do zaskakującego zwrotu, gdy zespół odkrywa, że zmarła prawdopodobnie przebywała w Stanach nielegalnie. Tymczasem Arastoo przygotowuje swoją dysertację do zatwierdzenia przez Brennan, co zbiega się z rozmową na temat małżeństwa pomiędzy nim i Cam.
Pod karuzelą znalezione zostają szczątki pracownika funduszu hedgingowego. Głównym podejrzanym w sprawie staje się szef ofiary. Aubrey martwi się z powodu emocjonalnych powiązań ze sprawą. Tymczasem Christine po raz pierwszy przeklina, a Brennan i Booth nie mogą dojść do zgody, jak w tej sytuacji postąpić z córką.
Na miejskim terenie wierceń hydrogeologicznych znalezione zostają szczątki mistrza rozwiązywania krzyżówek. Poszukiwania zabójcy pośród jego rywali ujawniają, że w chwili swojej śmierci, zmarły cierpiał na chorobę umysłową. Tymczasem położna Daisy udziela jej wsparcia, gdy przyszła mama tego najbardziej potrzebuje.
Śledztwo w sprawie zamordowania profesora psychologii w college’u ujawnia kontrowersyjne eksperymenty społeczne, które ten przeprowadzał na swoich studentach. Z tego powodu lista podejrzanych znacznie się wydłuża. Tymczasem Booth zostaje wykluczony z gry z powodu konieczności ukończenia kursu przepisów drogowych. Wendell musi poradzić sobie u uczuciami w stosunku do pielęgniarki, która podaje mu chemię w ramach leczenia raka.
Dwusetny odcinek serialu jest hołdem złożonym filmom Alfreda Hitchcocka. Jego akcja ma miejsce w Hollywood z lat 50. Brennan, detektyw z wydziału policji Los Angeles nawiązuje współpracę ze złodziejem biżuterii Boothem, który został wrobiony w morderstwo zamożnej bywalczyni salonów.
W gnijącym pniu drzewa znalezione zostaje ciało jasnowidzki. Zespół zwraca się o pomoc do Avalon Harmonii. Tymczasem Brennan i Booth mają odmienne zdanie odnośnie tego, w jaki sposób odnieść się do nowego, wymyślonego przyjaciela ich córki Christine. Zespół wspomina Sweetsa w dniu jego urodzin.
W opuszczonej księgarni znalezione zostają zwłoki nauczycielki. Podejrzenie pada na jej uczniów oraz współpracowników. Tymczasem stażystka Jessica Warren uczy Brennan, w jaki sposób używać Twittera, dzięki któremu Temperance będzie mogła nawiązać lepszy kontakt z fanami swoich książek.
Znalezione zostają pokawałkowane szczątki byłego więźnia. Dochodzenie prowadzi śledczych do miejscowej piekarni, znanej z tego, że zatrudniała byłych przestępców. Dowody wskazują na nieudany napad rabunkowy oraz pomagają w utworzeniu listy podejrzanych z przeszłości zmarłego. Tymczasem Arastoo zastanawia się nad powrotem do Iranu, by odwiedzić umierającego brata, co źle się odbija na jego związku z Cam.
Śmierć gwiazdy miniaturowego golfa ujawnia zaciekłą rywalizację w gronie osób uprawiających ten sport. Tymczasem Brennan obawia się, że jej ojciec zaplątał się znowu w jakieś nielegalne machinacje. Wendell prosi Hodginsa o pomoc w naprawieniu rodowej pamiątki, należącej do jego dziewczyny.
W przemysłowej niszczarce znalezione zostają szczątki hazardzisty, który dał się poznać grając o wysokie stawki. Śledztwo prowadzone w świecie nielegalnych rozgrywek pokera okazuje się wyzwaniem dla uzależnionego kiedyś od hazardu Bootha. Tymczasem Hodgins wymyśla produkt związany z laboratorium. Brennan i Booth otrzymują ekscytujące, rodzinne wiadomości.
Zespół prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci sławnego szefa kuchni. Ślady prowadzą ich do miejscowych restauracji. Tymczasem Hodgins sprzedaje swój nowy wynalazek za miliony dolarów. Brennan pomaga Christine w poznaniu nazw kości, pisząc piosenkę, która dziecku ułatwi ich zapamiętywanie.
W rowie znalezione zostają szczątki uczennicy prywatnego liceum. Okazuje się, że do jej śmierci przyczynić się mogło znęcanie przez innych uczniów. Brennan odkrywa podobieństwo pomiędzy doświadczeniami ofiary i własnymi, nabierając przekonania, iż nie doszło do morderstwa.
Za 48 godzin ma odbyć się egzekucja skazanego na śmierć seryjnego zabójcy, Alexa Rockwella. Brennan jednak zaczyna mieć wątpliwości odnośnie jego winy.
Arastoo zostaje porwany przez członka irańskiego parlamentu, który chce, by pomóc mu w rozwiązaniu sprawy morderstwa. Booth i Cam wyjeżdżają na Bliski Wschód, w celu ustalenia zabójcy zanim będzie za późno. Tymczasem Brennan jest zaniepokojona uzależnieniem Bootha od hazardu i prosi Aubreya, by ten ochraniał ją i Christine przed bukmacherem jej męża.
W pobliżu rzeki znalezione zostaje ciało kolekcjonerki ozdobnych pojemników na ciasteczka. Zabójcą może okazać się inna entuzjastka kuchennych przedmiotów. Tymczasem Booth nie może pogodzić się z decyzją Brennan, która domaga się, by mąż wyprowadził się z domu z powodu uzależnienia od hazardu. Aubrey nie spuszcza z oczu jednej ze stażystek.
Szczątki byłego więźnia oraz członka gangu motocyklowego, który został później instruktorem jogi znalezione zostają w zgliszczach po pożarze lasu. Śledczy muszą poznać oba światy, w których obracał się zmarły, by odnaleźć zabójcę. Tymczasem Booth nadal walczy ze swoim uzależnieniem od hazardu. Angela i Hodgins podejmują ważną decyzję odnośnie swojej przyszłości w Instytucie Jeffersona.
Szczątki ofiary znalezione na miejscu przestępstwa przypominają brudną robotę Christophera Pelanta. Zespół musi zajrzeć do starych akt okrytego złą sławą zabójcy, by znaleźć jego domniemanego protegowanego. Tymczasem Angela zastanawia się, czy Paryż jest odpowiednim miejscem dla niej i Hodginsa. Brennan i Booth rozważają zakończenie swojej kariery w odpowiednio Instytucie Jeffersona oraz FBI.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa Jasona Siedela, księgowego z departamentu stanu, którego szczątki znaleziono w hotelowym systemie klimatyzacyjnym. Booth nakrywa swojego dawnego kumpla z wojska oraz agenta CIA, Danny’ego Becka, w trakcie likwidowania dowodów w mieszkaniu ofiary i zaczyna zdawać sobie sprawę, że w przypadku Siedela może pojawić się więcej podejrzanych niż zespół początkowo przypuszczał. Booth zwraca się również do swojego przyjaciela i byłego księdza z czasów służby wojskowej o radę odnośnie związku z Brennan po tym, jak Pelant doprowadził między nimi do rozłamu. Tymczasem Brennan musi zadecydować,...
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa Adama Paka, doradcy ds. zarządzania, którego szczątki zostały zjedzone przez rude rysie. Ślady prowadzą do ośrodka wypoczynkowego dla małżeństw. Brennan i Booth wybierają się tam pod przykrywką jako Roxie i Tony, by znaleźć kolejne dowody w sprawie. Na miejscu, Brennan i Booth spotykają parę małżeńską, Billa i Evelyn Schumacherów, których związek wydaje się trochę zbyt idealny. Tymczasem Cam zostaje omyłkowo aresztowana po tym, jak ktoś kradnie jej tożsamość. Sweets postanawia na jakiś czas odpocząć od służby w FBI.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa Jamiego Delcampo, członka gangu Estrellas Locas, którego szczątki znaleziono w spalonym samochodzie. Tymczasem w obliczu najnowszego ataku Pelanta, Sweets, który niedawno zrobił sobie wolne, postanawia pomóc w dochodzeniu, gdy odkrywa, że młody chłopiec, z centrum, w którym pracuje jako wolontariusz, jest synem jednego z członków gangu.
Pelant powraca. Trzymani przez niego w garści członkowie zespołu z Instytutu Jeffersona chcą na zawsze z nim skończyć. Gdy do laboratorium dostarczone zostają ludzkie zwłoki, które przekazano do celów badawczych, naukowcy, z pomocą agenta specjalnego Hayesa Flynna, wymyślają plan polegający na zaaranżowaniu sceny zbrodni, naśladującej sposób działania Pelanta, by zwrócić jego uwagę i wykurzyć z ukrycia. Ich wysiłki przynoszą jednak odwrotny skutek, ponieważ Pelant wyprzedza ich o krok i wcześniej zabija kogoś bliskiego Boothowi. Tymczasem Sweets powraca z urlopu i jest przekonany, że agent Flynn nie jest tym, za kogo się podaje.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa dyrektora szkoły, Charliego McCorda. Na wieść o tym, że cierpi na nieuleczalną chorobę, mężczyzna stworzył stronę internetową, dzięki której ludzie mogli korzystać z jego inspirujących filmów za odpowiednią opłatą. Odkryte przez śledczych podejrzane wideo Charliego, uderzającego w twarz byłego mistrza wagi półciężkiej UFC, Chucka Liddella, naprowadza ich na stworzoną przez ofiarę listę rzeczy do zrobienia przed śmiercią, która pomaga im w rozwiązaniu sprawy. Tymczasem Brennan i Booth w końcu zaczynają planowanie swojego wesela. Sweets zdaje sobie sprawę, że może zostać zastąpiony...
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zamordowania Nancy Handelman, której ciało odkryto podczas próby ślubu Brennan i Bootha. Gdy sprawa zaczyna się robić bardziej poważna, niż wcześniej przewidywano, Cam i Angela starają się zachować szczegóły dotyczące śledztwa w tajemnicy przed Brennan, by ich koleżanka mogła skupić się na swoim wielkim dniu. Atmosfera robi się bardzo napięta, kiedy dochodzi do niesprzyjających zdarzeń, które tymczasowo wstrzymują ślub. Max przyjeżdża do miasta z podejrzanym marynarskim workiem pełnym pieniędzy.
Podczas miesiąca miodowego w Buenos Aires, Brennan i Booth nie są w stanie bezczynnie odpoczywać. Postanawiają pomóc Raphaelowi Valenzie, miejscowemu detektywowi i wielkiemu wielbicielowi książek Brennan, w rozwiązaniu sprawy zabójstwa nazistowskiego zbrodniarza wojennego, którego szczątki znaleziono w historycznym, masowym grobie. Tymczasem z powrotem w Waszyngtonie, Hodgins i Angela zmagają się z opieką nad Christine, pod nieobecność Bootha i Brennan.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa Seana Nolana, niedoszłego modela, którego splątane ciało znaleziono w zbudowanej przez bobry tamie. Naukowcy wkrótce odkrywają, że bezowocna kariera w modelingu sprawiła, że jedynym źródłem utrzymania ofiary było sprzedawanie swojej spermy. Jednakże, gdy zespół dowiaduje się, że Nolan sfałszował swoje dane, podejrzenie pada na osoby, które mogły ucierpieć z powodu jego oszustwa. Tymczasem Brennan ma trudności z zachowaniem norm towarzyskich i taktu po tym, jak zostaje wciągnięta w spór z autorką Tess Brown. Hodgins stara się wyhodować muchę, będąc nosicielem larwy.
Brennan zostaje ławniczką w procesie sądowym profesjonalnego zawodnika piłki nożnej, Petera Kidmana, którego oskarżono o zamordowanie swojej żony. Gdy Temperance stara się w obiektywny sposób dowieść, że zabójca jest niewinny, ginie jego najbliższy przyjaciel oraz kluczowy świadek w sprawie. Zespół z Instytutu Jeffersona zaczyna badać sprawę, by udowodnić, że gwiazdor piłki nożnej faktycznie winny jest zabójstwa zarówno swojej żony, jak i przyjaciela.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa technologa żywności. Szczątki ofiary wrzucono do maszyny do mielenia mięsa, po czym trafiły one do puszek z gulaszem, który serwowano w szkolnej stołówce. Gdy śledczy odkrywają najnowszy i bardzo dochodowy wynalazek naukowca, zaczynają tropić zazdrosnych konkurentów, działających w przemyśle spożywczym. Tymczasem Angela organizuje dla Brennan poślubny wieczór panieński, który robi się bardziej zwariowany od tego, co zaplanowała.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa gimnastyczki, startującej w krajowych zawodach, której szczątki zostały porażone piorunem i rozrzucone w publicznym parku. Chociaż dowody wskazują na koleżankę gimnastyczkę jako główną podejrzaną, Brennan i Booth odkrywają, że ofiara prowadziła podwójne życie. Tymczasem Booth denerwuje się, gdy Brennan okazuje zaskakującą empatię ojcu ofiary. Cam konfrontuje kobietę, która ukradła jej tożsamość.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zgonu Lany Brewster, dziewczyny, której zwłoki dostarczone zostały do domu Brennan i Bootha przez kogoś, kto nie uznał tego, co wydarzyło się przed 18 laty za wypadek. Gdy naukowcy odkrywają, że ofiarę zamordowano, a jej śmierć zatuszowano, osoby z przeszłości kobiety stają się głównymi podejrzanymi. Jedną z nich jest jej były chłopak, z którym Hodgins się kiedyś przyjaźnił. Tymczasem Brennan zaczyna ponownie mieć koszmarne sny związane z Pelantem i zdaje sobie sprawę, że psychopata mógł mieć coś wspólnego z zabójstwem Lany.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie śmierci Colina Haynesa, zmagającego się z trudnościami piosenkarza country, którego szczątki znaleziono w płytkim grobie. Informacje na temat kariery muzycznej ofiary naprowadzają śledczych na wytwórnię płytową, która, jak się okazuje, nie traktowała swoich podopiecznych w uczciwy sposób. Tymczasem stażysta Wendell Bray łamie sobie rękę podczas gry w hokeja. Brennan przygląda się bliżej jego urazom i odkrywa coś szokującego.
Zespół z Instytutu Jeffersona odkrywa ciało słynnego, aczkolwiek nielubianego mistrza szachowego w świńskich pomyjach. Sweets zaskakuje resztę ekipy swoimi umiejętnościami szachowymi i pod przykrywką wkracza w świat zawodowych rozgrywek szachowych, by odszukać zabójcę. Cam zostaje umieszczona w rankingu wybitnych kobiet nauki w specjalnym dodatku czasopisma branżowego, ale nie chce uznać tego zaszczytu, ponieważ obawia się, że tym samym urazi Brennan, która uważa, że to ona powinna zostać wyróżniona. Tymczasem ku niezadowoleniu Brennan, w laboratorium pojawia się dr Douglas Filmore, zawsze pogodny podiatra z Kanady.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa Lauren Frank, ofiary porywacza, której szczątki zakopano w parku. Po odkryciu nieszczęśliwych relacji dziewczyny z jej macochą, śledczy zaczynają podejrzewać, że zabójcą był ktoś z jej najbliższego otoczenia. Tymczasem Hodgins odkrywa szokującą tajemnicę dotyczącą jego rodziny. Brennan i Booth muszą zmierzyć się z powszechnym dylematem par – czy połączyć swoje fundusze.
Zamordowany zostaje informator pracujący dla Centralnej Agencji Wywiadowczej. Booth i agent CIA Danny Beck muszą ze sobą współpracować, by namierzyć afgańskiego terrorystę. Tymczasem Brennan chce pracować bliżej z Boothem w terenie i para musi rozważyć, w jaki sposób może się to odbić na ich rodzinie.
W septycznym zbiorniku znalezione zostają szczątki komornika. Zespół z Instytutu Jeffersona musi ustalić, kim jest zabójca. Gdy śledczy odkrywają, że ofiara miała burzliwą przeszłość, kluczowi świadkowie z jego młodości stają się potencjalnymi podejrzanymi. Tymczasem przystojny i czarujący Rodolfo Fuentes, który uciekł z Kuby, gdzie pracował jako antropolog sądowy, musi odbyć staż, by uzyskać stopień naukowy. Temperance zgadza się, by go wypróbować przy obecnej sprawie. Brennan i Booth prowadzą dyskusję dotyczącą religijnego wychowania Christine.
Znalezione zostają zwłoki aktora z dziecięcego programu telewizyjnego. Zespół z Instytutu Jeffersona udaje się za kulisy, by odkryć, kto zamordował ulubioną przez wszystkich postać Billa Marchewki. Gdy śledczy odkrywają, że aktor znany był ze swej rozwiązłości, zaczynają odkrywać mało prawdopodobnych podejrzanych. Tymczasem Booth i Brennan planują pierwsze przyjęcie urodzinowe dla Christine. Clark prosi członków zespołu o opinie na temat jego powieści.
Gdy Todd, zamożny kolekcjoner dzieł sztuki, pojawia się na własnym pogrzebie, zespół z Instytutu Jeffersona musi się dowiedzieć, do kogo należą skremowane zwłoki wystawione podczas ceremonii. Śledztwo zaczyna się komplikować po tym, jak naukowcy ustalają, że w urnie znajdują się szczątki trzech osób. Tymczasem Finn cieszy się swoim nowo odkrytym bogactwem, zdobytym dzięki sprzedaży jego pikantnego sosu. Druzgocące wiadomości od Michelle złamią mu jednak serce.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zgonu niedoszłej absolwentki uczelni artystycznej, która chorowała na tocznia. Jej zwłoki znaleziono wewnątrz pnia w lesie. Śledczy dowiadują się, że ofiara paliła marihuanę, by uśmierzyć ból, co naprowadza ich na ambulatorium, w którym pracowała. Odkrywają również bardziej szokujące szczegóły, które mogły przyczynić się do jej śmierci. Tymczasem po rozpoczęciu leczenia raka, Wendel Bray wraca do laboratorium i pracując przy sprawie, otwiera się bardziej na temat swojej choroby. Ujawnia przy tym szokujące informacje, które mogą spowodować wyrzucenie go z pracy. Booth przygotowuje się...
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa kobiety, której szczątki znaleziono na mokradłach. Gdy naukowcy zdają sobie sprawę, że jej ciało zostało kriogenicznie zamrożone zanim je porzucono, trafiają do zakładu przechowującego ciała ludzi w warunkach kriogenicznych, gdzie dowiadują się więcej na temat osobistego życia ofiary. Tymczasem Cam ma opory przed pierwszym spotkaniem z ojcem i matką Arastoo. Bootha czeka duży awans, który może wiązać się z przeprowadzką.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa pochodzącej z bogatej rodziny Stephanie McNamara, której szczątki znaleziono w parku narodowym. Po zapoznaniu się z okolicznościami śmierci kobiety , śledczy dochodzą do wniosku, że mogła być ostatnią ofiarą Zabójcy Ducha. Tymczasem zastępca dyrektora FBI szczególnie interesuje się tą szeroko nagłośnioną przez media sprawą. Kariera Bootha może wkroczyć na nowe tory.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi dochodzenie w sprawie śmierci Briana Thomasa, głównego trenera pływania w publicznym college’u, którego zwłoki porzucono na dnie studni. Gdy prawdopodobni podejrzani mówią Brennan i Sweetsowi, że Brian miał romans, śledczy szukają kolejnych dowodów i poznają szczegóły sekretnego życia ofiary. Tymczasem Sweets zastępuje Bootha w prowadzeniu śledztwa, podczas gdy ten przygotowuje się do zeznawania przed podkomisją Kongresu. W laboratorium pojawia się nowa stażystka, która zwraca na siebie uwagę Sweetsa.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zgonu Wesleya Fostera, blogera piszącego na temat teorii spiskowych, który przed swoją przedwczesną śmiercią miał spotkać się z Boothem, by przedyskutować poprzednią sprawę. Wiedząc, że ktokolwiek zabił Fostera, nie chciał, żeby doszło do jego rozmowy z Boothem, zespół musi ustalić, kto stoi za zabójstwem i jakie ma ono powiązania z poprzednią sprawą. W miarę jak śledczy zagłębiają się w spisek związany ze śmiercią mężczyzny, staje się jasne, że Booth znalazł się w trudnej sytuacji, a jego przyszłość w FBI stoi pod znakiem zapytania.
Oskarżona o zabójstwo Brennan, wraz z córką Christine, wciąż ukrywa się przed FBI. Pomaga jej w tym ojciec, Max. Koledzy z Instytutu Jeffersona robią wszystko, co w ich mocy, aby dowieść, że kobieta została wrobiona w morderstwo przez diabolicznego geniusza, Christophera Pelanta. Sprawa nabiera tempa dzięki anonimowej wskazówce, która prowadzi do odkrycia szczątków zaginionej przed ponad dziesięcioma laty szkolnej pedagog. Rozwiązanie zagadki jej śmierci może prowadzić do oczyszczenia Brennan z zarzutów.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zabójstwa wpływowego i bezwzględnego adwokata rozwodowego, który miał wielu wrogów. Wszystko jeszcze bardziej się komplikuje, gdy okazuje się, że młoda asystentka prawnika zniszczyła ważny materiał dowodowy, mogący przyczynić się do rozwiązania sprawy. Tymczasem Brennan usiłuje powrócić do normalnego życia. Jej stosunki z Boothem robią się coraz bardziej napięte. Nie ulega wątpliwości, że trzymiesięczna separacja odbiła się negatywnie na ich związku.
W hotelowym, podziemnym parkingu dochodzi do eksplozji. Zespół z Instytutu Jeffersona musi zbadać szczątki znalezione w miejscu wybuchu, aby ustalić kim jest ofiara. Dochodzenie robi się jeszcze bardziej pogmatwane, gdy okazuje się, że zidentyfikowany przez śledczych mężczyzna wcale nie jest martwy. Na prośbę Carolyn, Booth musi zająć się pracą przy biurku i uzasadnić wysoki poziom wydatków w budżecie wydziału. Sweetsowi zostaje przydzielona tymczasowo nowa partnerka, agentka Olivia Sparling.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie śmierci Jareda Drew, byłego właściciela sklepu z narzędziami, który dorabiał jako pracownik targów zoologicznych. Mężczyznę zastrzelono, ponadto wykryto u niego zatrucie krwi. Okazuje się również, że ofiara została zaatakowana przez tygrysa syberyjskiego – gatunek zagrożony, którego sprzedaż jest nielegalna. Tymczasem ku rozbawieniu Bootha, Brennan zastanawia się czy powinna w przyszłości kandydować na Prezydenta i wciąż wylicza swoje zalety. Sweets i Daisy przygotowują się do zamieszkania razem, co u obojga wywołuje całkiem odmienne odczucia.
W miejskim pojemniku na śmieci zostaje odkryte porzucone i straszliwie okaleczone ciało kobiety. Ofiarę wypatroszono i żywcem obdarto ze skóry. Zmarła to Jessica Pearson, współzałożycielka firmy produkującej sos jabłkowy, jednego z wielu biznesów działających w ramach rzemieślniczej społeczności. Kobieta była prześladowana przez miejscowego rzeźnika i skrywała wiele sekretów. Tymczasem od momentu zerwania z Daisy, Sweets pomieszkuje w swoim biurze. Booth proponuje mu zatrzymanie się u niego i Brennan dopóki nie znajdzie sobie nowego mieszkania.
Brennan zaczyna fascynować się koszykówką oraz filozofią legendarnego trenera Phila Jacksona, który stworzył koncepcję pracy zespołowej. W tym duchu wyznacza swoim pięciu najlepszym stażystom zadanie przeanalizowania nieprzebadanych dotąd szczątków ze zbioru Instytutu Jeffersona oraz podjęcia próby identyfikacji ofiar. Podczas śledztwa młodzi badacze odkrywają tożsamość mężczyzny, który zginął w wyniku ataku terrorystycznego z 11 września. Muszą ustalić czy był on sprawcą przestępstwa czy ofiarą.
Zespół z Instytutu Jeffersona musi ustalić okoliczności śmierci specjalisty, który zajmował się porządkowaniem miejsc zbrodni. Jego szczątki zostają znalezione w wyrzuconej przez morze na plażę zamkniętej szczelnie kapsule. Tymczasem Arastoo ujawnia zamiłowanie do poezji. Booth i Brennan starają się przekonać sceptycznie nastawionego Sweetsa do oddzielenia życia prywatnego od zawodowego. Natomiast Angela i Hodgins podejrzewają, że Cam ma sekretny romans.
Uliczny artysta, który potajemnie okleja billboard reklamowy swoją sztuką, spada z rusztowania i ląduje we własnym kleju oraz ludzkich szczątkach. Zespół musi nie tylko ustalić tożsamość ofiary, ale również znaleźć skuteczny sposób na usunięcie części zwłok, które są wciąż przyklejone do pleców pechowego graficiarza. Tymczasem Booth prowadzi poszukiwania potencjalnych podejrzanych i próbuje swoich sił w stand-upie. Angela zauważa, że podoba jej się uliczny artysta.
W szklarni zostaje znalezione porzucone ciało chłopca, którego dusza nie przeszła jeszcze na drugą stronę. Avalon Harmonia uważa, że zmarły ich obserwuje i będzie ich nawiedzał dopóki sprawa nie zostanie zakończona. Obecność jasnowidzki sprawia, że zespół zaczyna zastanawiać się nad swoimi przekonaniami odnośnie życia po śmierci. Brennan, która ma teraz własne dziecko, bardzo emocjonalnie podchodzi do ofiary. Okazuje się, że chłopiec to zaginiony przed dwoma laty czternastolatek – Colin Gibson. Początkowo podejrzenia padają na jego rodziców. Wkrótce, dzięki dostarczonym przez kolegów chłopca przedmiotom, na światło dzienne wychodzą nowe fakty...
Zespół z Instytutu Jeffersona bada okoliczności śmierci tancerki tańca towarzyskiego, która zginęła w przeddzień ważnego, telewizyjnego konkursu tanecznego – programu z nagrodą w wysokości pół miliona dolarów, gwarantującego zwycięzcom sławę i kontrakty reklamowe. W kręgu podejrzanych znajdują się były partner zmarłej, jego obecna partnerka oraz inni uczestnicy show. Booth, który dorabiał na studiach ucząc tańca towarzyskiego, wraz z Brennan postanawiają wziąć udział w konkursie i tym samym zbliżyć się do potencjalnego sprawcy. Tymczasem Hodgins i Wendell desperacko szukają sposóbu na usunięcie kryształów pokrywających kości ofiary.
Słynny podróżnik, autor książek i archeolog o wątpliwej reputacji zostaje zamordowany wkrótce po dokonaniu ważnego odkrycia naukowego. Zmarły znalazł mające tysiące lat kości przedstawicieli Neandertalczyków i Homo sapiens, którzy żyli ze sobą w tej samej jaskini. Być może jest to pierwsza tego typu para w historii. Brennan i dr Edison walczą o to, kto powinien zbadać starożytne szczątki. Sweets i Booth martwią się, że ambitne podejście Brennan do rozwoju Christine może odbić się niekorzystnie na psychice dziecka.
Hodgins i Angela zostają odurzeni gazem podczas snu, a po przebudzeniu się ze zgrozą odkrywają leżące na baldachimie ich łóżka wypatroszone i obdarte ze skóry zwłoki mężczyzny. Ponadto w kołysce ich synka ktoś rozsypuje nasączone krwią płatki kwiatów. Hodgins obawia się, że sprawcą może być żądny zemsty Christopher Pelant. W ramach śledztwa, zespół z Instytutu Jeffersona odkrywa, że ciało należy do agenta służb specjalnych powiązanego z organizacją werbującą najemników. Hodgins i Angela ignorują prośbę Bootha, by zgodnie z protokołem sprawą zajęło się FBI i rozpoczynają dochodzenie na własną rękę.
Zespół z Instytutu Jeffersona bada szczątki dwóch ciał, które znaleziono w tym samym miejscu pochówku na terenie parku narodowego. Jedno z nich należało do chorej na raka płuc, drugie do jej opiekunki, której zadaniem było udzielanie wsparcia pacjentce podczas choroby. Sprawa skłania członków zespołu do zastanowienia się nad własną śmiercią oraz rodzajem preferowanej przez nich metody pochówku. Daisy Wick i Sweets muszą współpracować ze sobą po raz pierwszy od swojego rozstania.
Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie śmierci profesjonalnej zawodniczki wyścigów na wrotkach. Jej poćwiartowane i potraktowane kwasem ciało zostało znalezione w rzeźni. Aby lepiej przyjrzeć się środowisku denatki, angażują do pomocy Angelę, która pod przykrywką wstępuje do drużyny wrotkarek. Tymczasem Cam stara się odkryć powód potajemnych wizyt Bootha w szpitalu, a Hodgins docieka, co dręczy Wendella.
Brennan zostaje postrzelona, pracując do późna w laboratorium. W stanie ciężkim przebywa w szpitalu, gdzie przez moment doznaje przeczących logice wizji zmarłej matki. Lekarze nie są w stanie znaleźć kuli, ani rany wylotowej. Zespół z pomocą agentki Olivii Sparling stara się ustalić tożsamość strzelca i dochodzi do wniosku, że sprawcą musi być ktoś pracujący w Instytucie Jeffersona.
Zespół z Instytutu Jeffersona bada szczątki piętnastolatka. Przez matkę i bliskich przyjaciół chłopak uznawany był za inteligentnego, choć miał problemy z nawiązywaniem kontaktów z innymi. Zespół odkrywa jednak, że ten rzekomo niewinny nastolatek wplątany był w nielegalną działalność i dwa tygodnie wcześniej brał udział w licealnej imprezie, podczas której brano narkotyki. W śledztwie dochodzi do nieprzyjemnego zwrotu po tym, jak nieletnia dziewczyna wyznaje, że została zgwałcona, co jeszcze bardziej pogrąża chłopaka. Tymczasem Finn zastanawia się czy powinien powiedzieć Cam, że jej córka przyjechała na weekend do Waszyngtonu.
W Instytucie Jeffersona pojawia się świetnie wykształcony nowy stażysta, Oliver Wells. Radość z wykonywanej pracy często pozbawia go zdrowego rozsądku, a wybitny intelekt sprawia, że bywa arogancki. Jego ekscentryczne aczkolwiek trafne uwagi działają Brennan na nerwy. Pomimo to Temperance stara się być bardziej otwarta na naukowe teorie i wziąć pod uwagę te, które wcześniej wykluczyła. Tymczasem Booth postanawia zainwestować w kosmiczne górnictwo, usiłując zapewnić Christine dobrą przyszłość. Brennan jednak uważa, że jej partner niepotrzebnie szasta pieniędzmi.
Zespół z Instytutu Jeffersona zajmuje się sprawą śmierci Symchaya Conteha. Jego szczątki odkryto w beczce na terenie zakładu, zajmującego się utylizacją niebezpiecznych odpadów. Młody mężczyzna był imigrantem z Sierra Leone, który pracował w kilku miejscach, starając się wiązać koniec z końcem. W miarę jak zespół zagłębia się w śledztwo, okazuje się, że Symchay jako siedmiolatek został wcielony do armii i zmuszony do zabijania. Arastoo, który również dorastał w rozdartym wojną kraju, podchodzi do całej sprawy bardzo emocjonalnie i ściera się z Hodginsem, ponieważ nie zgadza się z wynikami jego testów. Brennan i Booth zastanawiają się, gdzie pojechać...
Zespół bada okoliczności śmierci kobiety o imieniu Deanna, byłej sierżant piechoty morskiej, której zwęglone ciało znaleziono w uzbrojonym bunkrze. Ofiara została rok wcześniej zwolniona z wojska z powodu bójki z inną żołnierką. Miała także na swoim koncie inne przewinienia, w tym napaść na oficera. Podczas śledztwa okazuje się również, że kobieta wierzyła w nadchodzący koniec świata i należała do grupy osób przygotowujących się do apokalipsy. Tymczasem Sweets znajduje mieszkanie, które mu się podoba, ale Brennan i Booth wciąż wątpią w to, że przyjaciel wyprowadzi się z ich domu.
W zaparkowanym na pustej działce SUVie zostaje znalezione ciało funkcjonariusza policji, który jako tajniak prowadził śledztwo w sprawie szeregu napadów na bankomaty. Mężczyznę zastrzelono, po czym wyjęto kule, aby uniknąć identyfikacji. W okaleczonym ciele ofiary znaleziony zostaje także woreczek diamentów. Przebieg śledztwa filmowany jest przez żądnego mocnych wrażeń Andrew Jursica. Dokumentalista został zatrudniony do nakręcenia filmu, którego celem ma być zebranie środków na działalność Instytutu Jeffersona. Niestety sztywniacka osobowość Brennan nie robi najlepszego wrażenia i bardziej przeszkadza niż pomaga w ukazaniu przyjaznego oblicza...
Zespół prowadzi śledztwo w sprawie zamordowania telewizyjnej producentki. Kobieta pracowała przy tworzeniu sądowego reality show. Jej zadaniem była rekrutacja uczestników, których celowo podżegała, aby program był bardziej widowiskowy. Tymczasem Brennan jest zszokowana zachowaniem Christine, gdy ta zostaje posądzona o ugryzienie innego przedszkolaka. Hodgins wykorzystuje laboratorium Instytutu Jeffersona do odtworzenia receptury pikantnego sosu Finna.
Zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi śledztwo w sprawie zamordowania Jacka Spindlera, odnoszącego zawodowe sukcesy maklera, który wieczorami dorabiał na boku jako striptizer. Ciało mężczyzny, przebranego za strażaka, porzucono w budynku przeznaczonym do rozbiórki. Zabójca miał nadzieję, że wyburzenie za pomocą ładunków wybuchowych spowoduje zniszczenie dowodów zbrodni. Gdy śledczy dowiadują się, w jaki sposób dodatkowe zajęcie wpływało na życie osobiste denata, zaczynają przesłuchiwać najbliższych, w tym jego przyjaciela Storma, również striptizera. Tymczasem matka Bootha, której ten nie widział od 24 lat, pojawia się bez zapowiedzi i ma do...
Zespół z Instytutu Jeffersona gorączkowo stara się zapobiec rozprzestrzenieniu się zabójczego wirusa, jednocześnie prowadząc śledztwo w sprawie zabójstwa dziennikarki Mii Garrett. Kobieta była blogerką, piszącą o przemyśle farmaceutycznym i badaniach medycznych. Jak twierdzi jej chłopak, przed śmiercią zajmowała się jakąś dużą sprawą, o której nie chciała z nikim rozmawiać. Gdy wirusem, który zabił Mię zaraża się stażysta Arastoo Vaziri, jedyną szansą ratunku okazuje się rozwiązanie zagadki morderstwa. Członkowie zespołu muszą ścigać się z czasem, by jak najszybciej ustalić tożsamość zabójcy i stworzyć lek, który uratuje życie ich kolegi.
Zespół musi zmierzyć się z kolejną perfidią ze strony Christophera Pelanta, który najprawdopodobniej odpowiada za zabójstwa agentów FBI z najbliższego otoczenia Bootha. Pierwszą ofiarą morderczego geniusza jest zastrzelony w parku były partner Bootha, Alan Friedlander, który niedawno odszedł na emeryturę. Po kolejnych morderstwach, Sweets zdaje sobie sprawę, że Pelant włamał się do jego komputera i wykorzystuje wyniki jego własnych badań do zadawania kolejnych ciosów Boothowi i FBI. Podczas gdy Pelant drwi sobie z Bootha, zespół z Instytutu Jeffersona stara się odkryć sposób działania zabójcy, który napędza jego morderczy szał. W obawie o bezpieczeństwo...
Gdy zespół z Instytutu Jeffersona identyfikuje szczątki kobiety, znalezione na terenie do gry w paintball, znajdują również w jej aktach dwa zgłoszenia o zaginięciu. Booth i Sweets przesłuchują męża ofiary i dowiadują się, że cierpiała ona na amnezję. Gdy stażysta Wendell Bray odkrywa, że kobieta przeżyła również ranę po kuli, nieścisłości w jej medycznej kartotece ujawniają zaskakujące przestępstwo powiązane z jej zamordowaniem. Tymczasem Brennan i Booth przystosowują się do nowego życia w roli pary spodziewającej się dziecka i muszą poradzić sobie z nadchodzącymi zmianami w ich domu.
Zespół z Instytutu Jeffersona identyfikuje szczątki mistrza w jedzeniu na czas, na kilka dni przed startem Igrzysk Obżarstwa, największego konkursu tego typu, z wygraną w wysokości 10 tysięcy dolarów. Finn – nowy stażysta i młodociany przestępca, kojarzy niejasne dowody znalezione w brzuchu węża z prawami fizyki, pomagając w wyjaśnieniu sprawy. Pomimo swojej błyskotliwości w laboratorium, Finn traktowany jest z wrogością i sceptycyzmem co sprawia, że Cam zaczyna kwestionować swoją decyzję o daniu mu drugiej szansy. Tymczasem Booth zostaje zaskoczony oświadczeniem Brennan, dotyczącym ich dziecka. Chcąc załagodzić powstałe między nimi napięcie,...
Po tym, jak szczątki pracownicy firmy produkującej zabawki zostają znalezione owinięte w plastik wraz z lalką księcia z bajki, prezes korporacji umożliwia Boothowi i Sweetsowi dostęp do ściśle tajnego laboratorium prototypów, gdzie zaczynają wychodzić na jaw szczegóły z osobistego życia ofiary. Tymczasem Sweets, z pomocą swojej dziewczyny (stażystki Daisy Wick), przygotowuje się do testu ze strzelania, pomimo sprzeciwu Bootha, który uważa, że jego kolega nie powinien nosić przy sobie broni. Brennan zastanawia się, czy będzie dobrą matką i wykorzystuje pracę nad sprawą do zrozumienia wagi zabawek i bawienia się z dzieckiem.
W kilku paczkach, w dziale zwrotów przesyłek pocztowych, znalezione zostają rozczłonkowane szczątki mężczyzny. Naukowcy z Instytutu Jeffersona identyfikują ofiarę jako pracownika miejscowej firmy, zajmującej się usługami ksero i drukowania, gdzie niedawno personel podzielił się wygraną na loterii. Odkrywają również skomplikowany trójkąt miłosny, w który wplątany był zmarły i dwoje innych pracowników, będących małżeństwem. Podczas gdy motyw wskazuje na męża, kluczowa wskazówka pozwala zespołowi śledczych ostatecznie doprowadzić do wyjaśnienia przestępstwa. Tymczasem dziadek Bootha dzieli się niespodziewanymi wiadomościami, a agentka specjalna Genny...
Zespół odkrywa szczątki człowieka zajmującego się obserwacją zjawisk burzowych, który najprawdopodobniej zginął podążając za tornado. Jednakże materiał nagrany przez niego w trakcie trwania burzy, daje śledczym do zrozumienia, że mężczyzna został zamordowany. Tymczasem Booth robi się coraz bardziej nadopiekuńczy w stosunku do Brennan, zarówno w domu, jak i w pracy, a pozbawieni snu Angela i Hodgins w końcu zgadzają się, żeby ich małym synkiem zajął się ojciec Angeli, muzyk rockowy.
Zaszyfrowana wiadomość, zapisana ludzką krwią, zostaje odkryta na narodowym pomniku. W miarę jak zespół z Instytutu Jeffersona prowadzi poszukiwania istotnych wskazówek, śledczy zaczynają zdawać sobie sprawę, że ich podejrzany przez cały czas wyprzedza ich o krok. Tymczasem Booth i Brennan szukają idealnego domu dla swojej rodziny.
Szczątki uciekiniera skazańca zostają znalezione w kanalizacji w dzielnicy mieszkaniowej, ale badanie rur ściekowych wskazuje na to, że morderstwo miało miejsce w murach więzienia. Brennan upiera się, że będzie kontynuować pracę nad rozwiązaniem sprawy, pomimo błagań Bootha, by się nie nadwyrężała. W rezultacie para doświadcza bardzo nietradycyjnego nadejścia ich córki na świat.
Z pomocą agentki specjalnej Genny Shaw, zespół z Instytutu Jeffersona identyfikuje znalezione na drodze szczątki kobiety, której ciało po śmierci ciągnęła pod podwoziem osiemnastokołowa ciężarówka. Za życia, ofiara znana była z robienia tanich zakupów i korzystania z kuponów rabatowych. Tymczasem Brennan wraca do pracy po urlopie macierzyńskim, a Cam nie pochwala romansu swojej córki ze stażystą Finnem Abernathy.
W składowisku odpadów zostaje znalezione ciało pofarbowane niebieską substancją. Stażysta Arastoo Vaziri odkrywa metodę, która pomaga wyeliminować uszkodzenia zwłok powstałe po śmierci, co w rezultacie doprowadza zespół do salonu fryzjerskiego, gdzie pracowała ofiara. Tymczasem Brennan czuje się niekomfortowo w swoim ciele po urodzeniu dziecka, więc Booth postanawia zrobić coś specjalnego, by ją dowartościować.
W środku lasu zostają znalezione zwłoki pracownika firmy transportowej. Po przesłuchaniu syna ofiary, w poszukiwaniu motywu, Booth i Brennan odwiedzają miejsce, gdzie odbywają się jego zajęcia karate. Z powrotem w laboratorium, Hodgins przesadza przy zakupie sprzętu. Następnie syn Bootha, Parker, wraca z Anglii, a Brennan obawia się, jak chłopiec zareaguje na swoją nową siostrzyczkę.
Gdy w środku lasu znalezione zostają zwłoki, zespół odkrywa powiązania ofiary z dwiema rodzinami, które prowadzą spór od niemal stulecia. Dzięki szokującemu wyznaniu jednej z przesłuchiwanych osób, Booth i Brennan poznają motywy zbrodni. Tymczasem Temperance przeżywa trudne chwile po zaakceptowaniu propozycji swojego ojca, by opiekować się jej córeczką.
Brennan i Booth udają się do Los Angeles, by doradzać przy produkcji filmu opartego na najnowszej książce Temperance oraz pracy jej zespołu z Instytutu Jeffersona. W trakcie pobytu na planie, Brennan interweniuje z powodu błędów w grze aktorów, nie wspominając o kompletnym zlekceważeniu nauki. Następnie odkrywa, że używany w filmie rekwizyt zwłok to faktycznie ofiara morderstwa, co zmusza ją i Bootha do wszczęcia śledztwa, które ma rzeczywiste konsekwencje w krainie fantazji. Tymczasem Booth dostaje ofertę pracy na terenie studia oraz na jaw wychodzi żenująca informacja na temat przeszłości Cam.
Psychopatyczny geniusz technologiczny, Christopher Pelant, podejrzany w jednym w poprzednich dochodzeń prowadzonych przez Brennan i Bootha, pojawia się ponownie w sądzie z apelacją. Wiedząc do czego jest zdolny, Brennan i Booth informują o tym sędziego, po czym zostają wezwani na miejsce nowej zbrodni. Po ustaleniu, że ofiarą jest przyjaciel Brennan, który najprawdopodobniej został zamordowany przez Pelanta, zespół z Instytutu Jeffersona stara się udowodnić mu winę raz na zawsze. Jednakże, gdy organa ścigania analizują odkrycia naukowców, kluczowe dowody powiązane zostają z Brennan i to na nią pada podejrzenie.
Gdy reputacja i kariera Cam wiszą na włosku, zespół zjeżdża się z całego świata, żeby pomóc jej w rozwiązaniu sprawy niezidentyfikowanego chłopca. Jednostka Antropologii Sądowej straciła dużo wigoru po tym, jak jej członkowie postanowili zająć się osobistymi projektami, więc dopiero wspólna energia i wiedza na nowo zjednoczonego zespołu pozwoli na zebranie materiałów dowodowych i znalezienie odpowiedzi dla rodziny nieznanego chłopca.
Gdy w jaskini w Parku Narodowym zostają odkryte zwłoki pewnej pary, zespół musi ustalić tożsamość mężczyzny i kobiety, jak również rozwikłać zagadkę morderstwa. Dziewczyna Bootha, korespondentka wojenna z Afganistanu, Hannah Burley, przyjeżdża z niezapowiedzianą wizytą, co sprawia, że Brennan musi przemyśleć na nowo swoje własne relacje z Boothem.
Rozkładające się zwłoki, znalezione w na wybrzeżu New Jersey, zostają zidentyfikowane jako należące do 23-latka, który bawił się w popularnym klubie w poprzednią noc. Brennan w zaskakujący sposób wykazuje swoją znajomość pop kultury i wiedzy antropologicznej po obejrzeniu tego, co uważa za materiał dokumentalny na temat mieszkańców New Jersey, a co w istocie okazuje się umiejscowionym tam reality show. Zespół zaczyna lubić dziewczynę Bootha, Hannah, a Angela usiłuje utrzymać swoją ciążę w tajemnicy.
Na śmietniku zostają znalezione czaszka i rozkładające się ręce, a ofiarą okazuje się być łowca nagród, który poszukiwał Charlesa Bravermana, człowieka oskarżonego o zamordowanie swojego współpracownika. Tymczasem Brennan zostaje poproszona przez profesora Bunsena Jude’a, gospodarza programu telewizyjnego, o możliwość nakręcenia jednego z odcinków jego programu dla dzieci w Instytucie Jeffersona, gdzie Brennan ma wystąpić jako gość specjalny.
Czaszka obiecującego, młodego tancerza zostaje znaleziona zatopiona w betonie na miejscu budowy. Po odkryciu, że ofiara porzuciła balet dla hip hopu, dowody wskazują na podejrzaną, która była w sekretnym związku z ofiarą. Hannah zostaje postrzelona w trakcie prowadzenia dziennikarskiego śledztwa w podejrzanej dzielnicy miasta, a Brennan odkrywa, że skutki postrzału zagrażają jej życiu.
Ze 150-letniego statku niewolniczego Amalia Rose wypływają na powierzchnię ludzkie zwłoki, co prowadzi do odkrycia powiązanego z niedawnym morderstwem. Trop naprowadza Bootha i Brennan na inny rodzaj statku (łódź wycieczkową dla pań w średnim wieku), gdzie ofiarę widziano na chwilę przed śmiercią. Sweets zmaga się z utrzymaniem luźnych relacji z Daisy, a Cam odkrywa zaskakujące i emocjonalne powiązania z Amalią Rose.
W największej na świecie tabliczce czekolady, stworzonej przez ekscentrycznego producenta łakoci, znalezione zostają ludzkie zwłoki. Tymczasem Cam zmaga się z decyzją swojej córki odnośnie uczęszczania na uniwersytet, który nie spełnia jej wysokich standardów, a Hodgins prosi Angelę o zorganizowanie imprezy, w celu ogłoszenia swojej ciąży.
Ludzki szkielet z raną po postrzale dosłownie wtopił się w tablicę rozdzielczą zwęglonej ciężarówki, ale zespół odkrywa, że ani ogień ani kula nie zabiły mężczyzny. Żona ofiary jest nauczycielką w lokalnej szkole średniej, co prowadzi do odkrycia romansu nauczycielki z uczniem. Tymczasem Sweets ma opory z pomocą Daisy w zaliczeniu rządowego testu psychologicznego, a Hannah usiłuje zaprzyjaźnić się z synem Bootha, Parkerem.
Brennan widzi w przelocie swój własny los, gdy ciało wybitnej i nastawionej na karierę pani chirurg, której styl życia bardzo przypomina życie Brennan, odkryte zostaje w szemranej dzielnicy z wieloma złamaniami czaszki i bez żadnych wskazówek na temat tego, w jaki sposób lub dlaczego się tam znalazło. Dzięki zapewnieniom nowego przyjaciela i ochroniarza z Instytutu Jeffersona, Micah Leggata, Brennan dokonuje odkrycia na swój temat oraz uczy się, na czym polega podejmowanie ryzyka.
Niezidentyfikowane ciało zostaje odkryte w kabinie prysznicowej eleganckiego domu, należącego do młodej bywalczyni salonów. Rekonstrukcja szkieletu oraz dowody znalezione w odpływie wody ujawniają, że ofiarą była młoda Chinka, zatrudniona jako dystrybutorka podrabianych, damskich torebek, która desperacko pragnęła dopasować się do modnego, ekskluzywnego towarzystwa. Tymczasem Angela i Hodgins rozmawiają na temat swojego przyszłego domu i miejsca, w którym chcą wychowywać dzieci, a Booth otwiera się w stosunku do Hannah w kwestii uczuć jakie żywi do niego Brennan.
Gdy Heather Taffet, znana również jako „Grabarz”, wnosi ostatnią apelację po tym, jak skazano ją na śmierć, ktoś ją zabija strzałem z broni palnej. Zespołowi z Instytutu Jeffersona zostaje powierzone zadanie ustalenia dokładnie miejsca, z którego strzelał snajper, a podejrzenie pada na ojca Brennan, Maxa, a nawet Bootha jako wiarygodnych sprawców. Tymczasem Sweets usiłuje się trzymać po tym, jak staje niemal na linii ognia, w dosłownie chwilę po nieprzyjemnej rozmowie z „Grabarzem”.
Zostaje znalezione ciało z raną po kuli, przebrane za stracha na wróble, a zespół musi ścigać się z czasem, aby zdążyć przez burzą, która może zniszczyć materiał dowodowy. Trzy żony ofiary są również siostrami, a panująca pomiędzy nimi zazdrość oraz pragnienie zwrócenia na siebie uwagi męża spowodowały rozłam w rodzinie. Tymczasem Cam traci pewność w kwestii swojej relacji z będącym wciąż pod telefonem chłopakiem lekarzem, ale oboje zdają sobie sprawę, że muszą swojemu związkowi dać pierwszeństwo.
Zwłoki uprawiającego ekstremalną jazdę rowerzysty, pokryte warstwą grzyba, zostają odkryte na dachu budynku magazynowego. Gdy Booth i Brennan znajdują skradziony rower ofiary, zespół dochodzi do wniosku, że ofiara została zabita wskutek tępego uderzenia, co sprawia, że jego śmierć podlega kryminalnemu śledztwu. Tymczasem Sweets zwraca się do Bootha o radę odnośnie oświadczenia się Daisy, a Booth robi wielki gest, by pokazać Hannah swoje zaangażowanie w ich związek.
Rozpuszczone zwłoki organizatorki wesel zostają znalezione w jej domowym łóżku do opalania w Walentynki, a Cam naciska na członków swojego zespołu, żeby skończyli na czas, by mogła świętować ze swoim chłopakiem. Tymczasem Booth i Brennan umniejszają znaczenie Walentynek, a Hodgins próbuje zaplanować romantyczny dzień dla Angeli, ale Clark pomaga mu zdać sobie sprawę z tego, że najbardziej znaczące prezenty pochodzą z serca.
Rozpuszczone zwłoki organizatorki wesel zostają znalezione w jej domowym łóżku do opalania w Walentynki, a Cam naciska na członków swojego zespołu, żeby skończyli na czas, by mogła świętować ze swoim chłopakiem. Tymczasem Booth i Brennan umniejszają znaczenie Walentynek, a Hodgins próbuje zaplanować romantyczny dzień dla Angeli, ale Clark pomaga mu zdać sobie sprawę z tego, że najbardziej znaczące prezenty pochodzą z serca.
Po zamordowaniu „Grabarza”, pozostający na wolności Jacob Broadsky uderza ponownie. Tym razem jego ofiarą jest były podejrzany, który wymknął się systemowi sprawiedliwości. Booth korzysta ze swojego wojskowego wyszkolenia, w celu pobicia snajpera w jego własnej grze oraz przysięga, że zrobi wszystko co w jego mocy, żeby sprawiedliwości stało się zadość. W gorącym i dramatycznym starciu, Booth ma jedynie minuty na złapanie Broadsky’ego zanim ten zastrzeli wybraną ofiarę, ale umiejętności i szybkość snajpera czynią z niego trudnego przeciwnika. Tymczasem Instytut Jeffersona odwiedza ojciec Angeli i nalega na nadanie imienia jego nienarodzonemu wnukowi.
Ciężka zamieć doprowadza do odcięcia energii elektrycznej w całym mieście, powodując dodatkowe utrudnienia, które musi pokonać zespół, chcąc wyjaśnić przypadek morderstwa, prawdopodobnie powiązanego z potencjalnym wybuchem epidemii wirusa. Gdy Booth i Brennan zostają uwięzieni w windzie, Sweets robi więcej, niż go o to poproszono, inicjując drażliwą rozmowę na temat relacji Bootha i Brennan. Tymczasem Angela i Hodgins otrzymują niepokojące informacje na temat zdrowia ich nienarodzonego dziecka, a Hodgins i Wendell próbują zidentyfikować ofiarę i rzadką chorobę.
Siedem par odciętych stóp wypływa na brzeg po powodzi na amerykańsko-kanadyjskiej granicy. Sześć z nich należy do zwłok z pobliskiego uniwersyteckiego ośrodka badawczego. Gdy kanadyjski podolog sądowy, dr Douglas Filmore, zabiera pozostałości z powrotem do Kanady, on i dr Brennan podejmują współpracę. Rzadka i droga para tenisówek naprowadza zespół na mordercę ofiary. Tymczasem Cam robi plany związane z collegem dla córki, za jej plecami.
Zwłoki gospodarza telewizyjnego programu obalającego mity, znalezione na dzikim terenie, sprawiają wrażenie jakby mężczyzna padł ofiarą mitycznej chupacabry, stworzenia, które starał się zdemaskować. Wśród podejrzanych znajduje się gospodarz z rywalizującego kanału, kryptozoolog i jasnowidz zwierzęcy, ale taśma z miejsca zbrodni oraz szczególne znaki zębów na zwłokach ofiary doprowadzają zespół do prawdy. Tymczasem alkoholik na odwyku, zezulec Vincent Nigel-Murray, przeprasza każdego z członków zespołu i dokonuje zaskakujących zwierzeń.
Zwłoki ochroniarza z muzeum marynistycznego zostają znalezione na bagnach Florydy po tym, jak usiłowano ukraść przestarzały fragment morskiej mapy, używany do odnajdywania skarbów. Booth prosi o pomoc Waltera Shermana, byłego żołnierza z Iraku, który posiada osobliwy dar odnajdywania osób i rzeczy. Jednak, gdy zostaje znaleziona zamordowana kobieta, a przy niej pozostałości mapy, zespół odkrywa wieki historii powiązanej z mapą i podejrzanego o popełnienie przestępstw. Tymczasem Brennan poddaje godne podziwu umiejętności Shermana testowi, a Booth żywi urazę do swojego byłego kompana z wojska.
Ciało mężczyzny pracującego w reklamie zostaje znalezione na rabacie nowo wybudowanego placu zabaw. Ofiara spaliła za sobą mosty przyjmując agresywne podejście do szczerości i była członkiem grupy wsparcia hołdującej radykalnej uczciwości. Ekipa z Instytutu Jeffersona usiłuje przyjąć bardziej uczciwą metodę komunikowania się, która nie zawsze służy dobrym relacjom, a Angela zachęca Hodginsa do konfrontacji z realiami jej ciąży.
Piętnastoletnia dziewczynka o nieznanej tożsamości, która nie słyszy i nie jest w stanie się komunikować, zostaje znaleziona na ulicy cała we krwi, dzierżąc nóż w ręku, co sprawia, że zespół wierzy, iż jest ona odpowiedzialna za niedawno popełnione morderstwo. Tymczasem Angela utrzymuje Hodginsa w nieświadomości odnośnie szczegółów dotyczących jej ciąży.
Gdy grasujący na wolności snajper Jacob Broadsky zabija kolejną ofiarę, Booth staje się jeszcze bardziej zdeterminowany niż kiedyś, żeby złapać nieuchwytnego przeciwnika. Po tym, jak kula przeznaczona dla Bootha trafia w niewinną ofiarę, Booth postanawia za wszelką cenę dopaść Broadsky’ego na dobre.
Zostają znalezione niezidentyfikowane i okropnie zmasakrowane zwłoki mężczyzny, tkwiące w automacie do ustawiania pinów na torze do gry w kręgle. Nie mogąc natrafić na żaden jasny trop w sprawie, Booth i Brennan pod przykrywką przyłączają się do bardzo konkurencyjnej drużyny kręglarzy, mając nadzieję na znalezienie wskazówek.
Znajoma wróżka Angeli (gościnnie Cyndi Lauper) przepowiada, że pod fontanną znajduje się wiele pogrzebanych zwłok. Trop okazuje się trafny, a Booth i Brennan znajdują szczątki jedenastu ciał dokładnie tam, gdzie wskazała jasnowidzka. Tymczasem Sweets poświadcza zdolność Bootha do powrotu do służby po operacji mózgu, ale ten wciąż doświadcza efektów ubocznych.
1212Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie ciała mężczyzny, zamordowanego z powodu nieujawnionej zawartości jego aktówki. Początkowo materiał dowodowy prowadzi zespół do podejrzeń, że mają do czynienia z agentami tajnych służb, a ich teorie wspierane są przez znajdujące się w stanie ciekłym szczątki agenta CIA, które odkryto w bagażniku pewnego samochodu. Tymczasem bestseller Brennan okazuje się sukcesem finansowym i staje się powodem sporu z Boothem. Wendell, stażysta z Instytutu Jeffersona, traci swoje stypendium.
1212Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie morderstwa genialnego pianisty Amisza, który zaginął przed około dwoma miesiącami podczas tzw. Rumspringa – obyczaju Amiszów, którego celem jest odkrywanie świata zewnętrznego przez młodych. Tymczasem Cam musi poradzić sobie ze stresem wynikającym z zostania rodzicem, a Booth pomaga utrzymać Michelle, przybraną córkę Cam, w ryzach.
1212Brennan i Booth badają sprawę ludzkich szczątków znalezionych podczas sąsiedzkiej imprezy. Polityka przedmieścia i utajone skandale dają motyw każdemu z mieszkańców ślepego zaułka, przez co Brennan, Booth i Sweets muszą oddzielić ziarno od plew usiłując znaleźć podejrzanego. Arastoo, stażysta w Instytucie Jeffersona, mówi całą prawdę na temat swojego pochodzenia, a syn Bootha próbuje znaleźć mu dziewczynę.
1212Zwęglone szczątki ludzkie okazują się mumią egipskiego księcia wypożyczoną Instytutowi Jeffersona. Kiedy kustoszka instytutu przygotowująca mumię do wystawy zostaje zamordowana, zespół podejrzewa zabójstwo. Śledztwo w sprawie śmierci pani kustosz rzuca nowe światło na życie mumii, co zmienia sprawę w dochodzenie o historycznym znaczeniu. Brennan idzie na randkę z szefem Bootha. Do pracy w laboratorium wraca dziewczyna Sweetsa, Daisy Wick.
1212Zostają znalezione zmasakrowane szczątki lokalnego hodowcy drobiu. Miał odziedziczyć farmę-fabrykę kurczaków, znaną i oprotestowywaną z powodu okrutnego traktowania zwierząt. Farmer miał wielu wrogów, w tym ekstremalnego działacza praw zwierząt oraz zawziętych sąsiadów. Angela jest dotknięta sposobem prowadzenia farmy i uruchamia swoją własną kampanię praw zwierząt.
1212Booth musi ponownie uzyskać poświadczenie umiejętności strzeleckich wydawane przez FBI, ale nie jest już tak dobrym strzelcem jak przed operacją mózgu. Zespół prowadzi śledztwo w sprawie morderstwa bardzo niskiej osoby, która walczyła jako zapaśnik o pseudonimie „Żelazny Krasnal”.
1212Dziadek Bootha, Hank, przyjeżdża, żeby z nim zamieszkać i ciągnie się za Brennan i Boothem, którzy prowadzą dochodzenie w sprawie zwęglonych i spopielonych zwłok, znalezionych przez pośredniczkę handlu nieruchomościami podczas pokazywania domu potencjalnym kupcom. Zespół identyfikuje ofiary jako dwoje otyłych kochanków, z których żadne nie wydawało się mieć wrogów. Hank stara się zabawić w swata Bootha i wtajemnicza Brennan w niektóre rodzinne sekrety.
1212Zwłoki lubiącego rywalizację gracza, jedynego, który kiedykowiek uzyskał idealny wynik w słynnej grze wideo, zostają odkryte w ciężarówce gastronomicznej. Gracz brał pieniądze od fanów za grę na urządzeniu, które dało mu idealny wynik, ale jego dochodowe przedsięwzięcie i status mistrza przysporzyły mu również wielu wrogów. Tymczasem Hodgins, Sweets i Colin wymieniają się w kolejce po bilety na filmową premierę.
1212Gdy mężczyzna przebrany za Świętego Mikołaja wysadza się w powietrze podczas nieudanego napadu na bank, Brennan i Booth pracują nad zidentyfikowaniem bombiarza i ustaleniem jego motywów. Brennan planuje spędzić Boże Narodzenie w Salwadorze, ale jej ojciec przekonuje ją do zostania na święta z nim i Margaret Whitesell (gościnnie Zooey Deschanel), nowo odkrytą daleką krewną.
1212W Nowym Meksyku znalezione zostają ludzkie zwłoki o pozaziemskich cechach. Ofiara była lokalną fanatyczką UFO, której nieustające poszukiwania obcego życia dostarczyły „dowodów”, które nawet Brennan i Booth uznali za przekonujące. Angela i stażysta Wendell wyznają całą prawdę na temat swojego związku.
1212Agenci rządowi przejmują kontrolę nad Instytutem Jeffersona i żądają, żeby Brennan i jej zespół ustalili przyczynę śmierci niezidentyfikowanych, ale ściśle tajnych szczątków. W miarę jak zespół zaczyna podejrzewać, że badają sprawę słynnego prezydenckiego zamachu, szef Bootha pomaga mu wedrzeć się do laboratorium i dowiedzieć się prawdy. Sfrustrowana Cam martwi się, że Michelle może ukrywać przed nią wielką tajemnicę.
1212Ludzki szkielet zostaje odkryty w okopach pola bitwy z czasów wojny secesyjnej, ale kości należą do lokalnego dentysty. Brat Bootha, Jared, wraca ze swoich podróży i ma dla niego niespodziewane wiadomości.
12Brennan i Booth prowadzą dochodzenie w sprawie układu unikalnie zdeformowanych zwłok, które stanowią alegorię biblijnego tekstu. Ofiara to były pacjent zakładu dla psychicznie chorych, trudno więc scharakteryzować podejrzanych jako dobrych lub złych. Stażysta Arastoo Vaziri ujawnia tajemnicę na temat swojej przeszłości.
12Gdy pociąg kolei podziemnej zostaje wyrzucony z szyn przez 60 000 galonów wody powodziowej, z wypływu ujawnia się częściowo zeszkieletowane ciało. Podczas gdy dr Sweets (pasażer wykolejonego pociągu) stara się poradzić sobie ze stresem pourazowym, reszta zespołu i stażystka Daisy Wick ustalają tożsamość ofiary, którą okazuje się zawodowy pisarz-widmo, uwikłany w miłosny trójkąt. Brennan wydaje swoją drugą książkę z wielkim sukcesem, ale musi sobie poradzić ze wścibską reporterką. Bycie świadkiem śmierci współpasażera skłania Sweetsa do podjęcia przełomowej decyzji.
12W setnym odcinku „Kości”, Brennan i Booth wspominają pierwszą sprawę nad którą razem pracowali, której opis ma zostać włączony do prawie ukończonej książki Sweetsa. Młody i buntowniczy Booth zwraca się o pomoc do zespołu antropologów naukowców i ulicznej artystki. Chociaż poruszają się po nieznanym terytorium, dr Brennan, jej student podyplomowy Zack i Hodgins z miejsca zabierają się do pracy, robiąc wrażenie na detektywie dzięki talentowi do odkrywania nowych wskazówek oraz wspieraniu dowodami teorii Bootha, dotyczącej ustosunkowanego sędziego okręgowego.
12Brennan i Booth udają się pod przykrywką małżeńskiej pary na zjazd absolwentów jej liceum, w celu przeprowadzenia śledztwa odnośnie morderstwa jednej z jej klasowych koleżanek. Nawet jako dorosła, Brennan jest wciąż przewidywalnie niezrozumiana, a jej jedynym przyjacielem okazuje się dziwnie mroczny i niekonwencjonalny woźny. Tymczasem Hodgins wyjawia laboratoryjny sekret.
12W brzuchu rekina zostają odkryte ludzkie szczątki. Gdy dowody wskazują, że ofiara padła łupem wielu ryb, zespół przeprowadza śledztwo w Akwarium Atlantyku, gdzie zaginął występujący gościnnie wykładowca – cieszący się złą sławą guru od życiowych porad (wierzący w leczniczą moc oceanu). Tymczasem zarówno Brennan, jak i Booth muszą odnaleźć drogę w swoim związku, gdy pani biolog morska ujawnia swoje zainteresowanie Boothem.
12Gdy w hotelowej pralce zostaje znalezione ciało bogatego poszukiwacza przygód, śledztwo Bootha i Brennan naprowadza ich na rock’n’rollowy obóz spełnionych marzeń. W laboratorium, fragment kła prehistorycznego mamuta (znaleziony przy szczątkach) oraz wiedza Angeli na temat branży muzycznej zostają wykorzystane do powiązania dowodów z potencjalnymi podejrzanymi. Tymczasem Cam szuka lekarza dla swojej córki Michelle.
W leśniej chacie dochodzi do pożaru, który ujawnia dwa ciała – jedno współczesnej czarownicy i drugie, które pochodzi z czasów procesów czarownic w Salem – co prowadzi Bootha i Brennan do środowiska neopogaństwa w poszukiwaniu zabójcy. Gdy brawurowa jazda Hodginsa powoduje, że on i Angela zostają aresztowani i lądują w więzieniu, Sweets i stażysta Clark Edison wkraczają na nieznane terytorium, aby pomóc zespołowi.
Proces Grabarza dotyka osobiście członków zespołu i wszyscy w Instytucie Jeffersona muszą pracować w nadgodzinach, żeby znaleźć dowody, które zapewnią wyrok skazujący.
W celu rozwikłania tajemnicy jego śmierci, zespół pracuje nad odkryciem wskazówek zagrzebanych pod gromadzonym przez całe życie dobytkiem nałogowego zbieracza. Ojciec Angeli ma konkretny cel związany z jego ostatnią wizytą, a Brennan i Booth stają w obliczu niezwykłych możliwości.
Podczas wygłaszania gościnnych wykładów w Londynie, Brennan i Booth zostają poproszeni przez Scotland Yard o pomoc brytyjskim kolegom w śledztwie dotyczącym zamordowania młodej dziedziczki. Powraca mąż Angeli.
Pritchard prosi Bootha i Brennan o pomoc w kolejnym śledztwie, które dotyczy zamordowania znajomej osoby. Impulsywna decyzja Cam prowadzi do niezamierzonych konsekwencji.
W wychodku zostaje znalezione ciało gospodarza popularnego, telewizyjnego reality show. Brennan i Booth muszą zidentyfikować mordercę z dużej puli podejrzanych, z których wielu zostało upokorzonych w ramach programu ofiary. Booth dowiaduje się, że Brennan żongluje dwoma związkami.
12Kiedy syn Bootha znajduje odcięty palec w ptasim gnieździe, ślady prowadzą do weterynarza, który ma powiązania z ludźmi zajmującymi się nielegalnymi walkami psów. Sweets konfrontuje Hodginsa w kwestii jego zachowania w laboratorium.
12Pozbawione głowy ciało, znalezione w tajemniczym, fioletowym zbiorniku wodnym, należy do cierpiącego na zaburzenia obsesyjno-kompulsyjne i mającego fobię na punkcie drobnoustrojów pisarza science fiction. Bez głowy, nie ma wystarczających dowodów, żeby znaleźć zabójcę... dopóki pomocy nie udziela Zack.
1212W szybie windy budynku biurowego znalezione zostają zwłoki ogólnie nielubianej kierowniczki biura pewnej firmy. Hodgins i Angela starają się ułożyć swoje stosunki po zerwaniu ich związku.
12Booth i Brennan prowadzą śledztwo dotyczące śmierci kobiety-pastora ze stanu Maryland o tajemniczej przeszłości. Jej implanty w piersiach i brakująca dolna część ciała prowadzą do mylnych wniosków.
12Kiedy w skonfiskowanym samochodzie ze złomowiska, odkryte zostają zmiażdżone szczątki słynnego artysty, zespół ściga się z czasem, żeby znaleźć dowody morderstwa, zanim samochód zostanie wystawiony w galerii... jako ostateczny wyraz samopoświęcenia się artysty na rzecz swojej sztuki. Wśród podejrzanych znajduje się była dziewczyna Angeli.
12Brat Bootha, Jared i Brennan badają ciało znalezione podczas nalotu policji. Ofiara jest ojcem wynalazcy, który miał trudne relacje z synem. Kiedy odleziono drugi korpus wychodzi na jaw, że szczątki należą do oszusta, który podszywał się po ojca wynalazcy. Tymczasem Brennan idzie na randkę z bratem Bootha, gdzie wiele dowie się o przeszłości współpracownika.
12Booth i Brennan lecą do Chin. Podczas lotu w mikrofalówce pokładowej odnaleziono ugotowane ludzkie szczątki. Booth i Bones muszą wysłać dowody do Instytutu Jeffersona i rozwiązać zagadkę zanim samolot wyląduje i nie będzie podlegał jurysdykcji USA.
12Kiedy w skonfiskowanym samochodzie ze złomowiska, odkryte zostają zmiażdżone szczątki słynnego artysty, zespół ściga się z czasem, żeby znaleźć dowody morderstwa, zanim samochód zostanie wystawiony w galerii... jako ostateczny wyraz samopoświęcenia się artysty na rzecz swojej sztuki. Wśród podejrzanych znajduje się była dziewczyna Angeli.
12Booth i Brennan muszą zinfiltrować wędrowny cyrk, w celu przeprowadzenia śledztwa, dotyczącego połączonych ze sobą bliźniąt żonglerów. Robią to, pracując pod przykrywką, jako para demonstrująca pokaz rzucania nożami.
12Booth zostaje podejrzanym w sprawie morderstwa hokeisty, z którym miał scysję podczas niedawnej, wspólnej gry. Brennan musi zatem pracować przy śledztwie z agentką FBI Payton Perottą. Gdy Booth powraca na lodowisko, dostaje radę od jednego ze swoich hokejowych idoli, byłej gwiazdy Los Angeles Kings – Luca Robitaille’a.
12Grabarz – seryjny morderca powraca i porywa Bootha, domagając się aby dowody, które doprowadzą do jego ujęcia – dowody, które w tajemnicy zbierał Hodgins, nie przekazując ich FBI – zostały mu oddane w zamian za uwolnienie Bootha.
12Ciało kobiety, ubrane w suknię średniowiecznej księżniczki, prowadzi do śledztwa na terenie targów o tematyce science fiction i fantasy. Unieruchomionego Bootha zastępuje agentka Perotta. Dzięki informacjom udzielonym przez nudnego zezulca, Colina Fishera, śledczy dowiadują się, że ofiara mogła być w posiadaniu bardzo cennej pamiątki, dla której wielu dopuściłoby się do zabójstwa.
1212Sprzedawca samochodów, znaleziony martwy w wąwozie, nie żył już zanim zrzucono go z mostu, co wykluczyło samobójstwo. W laboratorium, kości ofiary zaczynają się pienić, co doprowadza do natychmiastowego zamknięcia placówki. Zespół zdaje sobie sprawę, że pozostała im jedynie doba na ustalenie przyczyny śmierci, zanim kości ulegną całkowitemu zniszczeniu.
12W kopcu soli zostaje znalezione skamieniałe ludzkie ciało. Ofiarą jest 16-letnia siatkarka z liceum, która zaginęła trzy tygodnie temu i była częścią domniemanego „paktu ciążowego” wraz z koleżankami z drużyny. Kiedy Angela i Roxie rozmawiają na temat adoptowania psa, muszą skonfrontować poważniejsze problemy w swoim związku.
12W klatce w zoo, zostaje znalezione w połowie zjedzone ciało byłego narzeczonego Cam. Booth i Brennan ustalają, że śmierć nie była przypadkowa. Zespół sprawdza wydarzenia ostatniego wieczoru ofiary i przesłuchuje podejrzanych, wśród nich Brandona Caseya, którego Sweets i Angela hipnotyzują, żeby odświeżyć mu pamięć.
12Zszargane, sproszkowane szczątki ludzkie zawierają kawałek meteorytu, który naprowadza zespół na laboratorium fizyczne w Waszyngtonie. Ofiara była zaręczona z założycielem laboratorium i pracowała nad wyjątkowo kontrowersyjnym projektem, przez który wielokrotnie grożono jej śmiercią. Tymczasem przyjeżdża ojciec Angeli, chcąc zemścić się na Hodginsie, a Sweetowi udaje się załagodzić sytuację.
12Wizerunek Marii Dziewicy, który ukazuje się w fabryce recyklingowej, okazuje się być zarysem zasuszonej ludzkiej krwi, który pochodzi ze spłaszczonego ciała. Ofiara od lat planowała perfekcyjne wesele, ale śledczy odkrywają, że jej narzeczony nie był jednym mężczyzną w jej życiu. Dziewczyna Sweeta, Daisy, zostaje zauważona jak mierzy ślubną suknię w towarzystwie innego mężczyzny. Hodgins i Angela w końcu ustalają status swojej znajomości.
12Ludzki szkielet, używany jako rekwizyt dla death-metalowego zespołu, okazuje się być szczątkami zamordowanego basisty o imieniu Mayhem, z zespołu o nazwie Spew. Sweets prosi dr Gordona Wyatta o recenzję swojej książki na temat Bootha i Brennan i dostaje interesującą opinię odnośnie wyjątkowej relacji tej pary.
12Kiedy jeden z jej kolegów umiera, rzekomo na atak serca, Brennan znajduje w jego ciele złamane kości. Nie mogąc uzyskać nakazu sądowego, który powstrzymałby kremację, ona i Cam kradną zwłoki, żeby je przebadać. Odkrywają, że denat został otruty, zapadł w śpiączkę, przez pomyłkę został uznany za zmarłego przez koronera, po czym został później zadźgany nożem przez zaskoczonego przedsiębiorcę pogrzebowego, gdy ciało zaczęło mieć skurcze. Zespół ściga się z czasem, żeby znaleźć prawdziwego mordercę, zanim ktokolwiek zauważy, że ciało zniknęło.
12Kiedy w Waszyngtonie znika siostra japońskiego detektywa, Booth i Brennan znajdują jej odciętą głowę, a wynikłe z tego śledztwo prowadzi do elitarnej agencji towarzyskiej. Gdy odkrywają, że współlokatorka ofiary również zaginęła, muszą ścigać się z czasem, żeby odnaleźć zabójcę.
12Kiedy znalezione zostaje martwe ciało w kostiumie wydry (uniwersyteckiej maskotki), Brennan i Booth dochodzą czy ofiara nie żyła wcześniej, czy została zabita podczas studenckiego ogniska. Ofiara – chłopak z braterstwa, o ksywej Bóbr, prowadził interesy na boku i zbijał własną fortunę. Booth oferuje pomoc swojemu bratu Jaredowi w znalezieniu nowej pracy po tym, jak został wydalony z marynarki.
1212Ciało krytyka wina zostaje znalezione wewnątrz beczki z trunkiem, podczas degustacji. Zjadliwie okrutny koneser miał wielu wrogów. Tymczasem Brennan chce mieć dziecko i prosi Bootha, żeby został ojcem. Prośba ta wyciąga na światło dzienne mnóstwo niewypowiedzianych emocji i nierozwiązanych problemów między partnerami. Stres, w połączeniu z niezdiagnozowanym problemem zdrowotnym Bootha prowadzą do halucynacji, w których pojawia się diaboliczny niemowlak Stewie Griffin z serialu „Family Guy: Głowa rodziny”, który oferuje Boothowi poradę.
1212Wszyscy stają się podejrzanymi, gdy zostaje znalezione ciało osoby zamordowanej w popularnym nocnym klubie, znanym jako Laboratorium. W tym niezwykłym splocie wydarzeń, Brennan, Booth i zespół z Instytutu Jeffersona przyjmują różne role, inne od ich normalnych obowiązków, w tym jako personel klubu, jak również przedstawiciele lokalnej policji. W odcinku występują także Ryan O’Neal jako Max Keenan, Brendan Fehr jako Jason Booth oraz członkowie zespołu Mötley Crüe.
1212W przednią szybę samochodu nastolatków, wbija się czaszka. Podczas badania szczątków, Brennan i Cam znajdują ślady ludzkich zębów, które mogą wskazywać na kanibalizm. Idąc tropem personaliów ofiary, śledczy trafiają na kanibalizującą społeczność. Tymczasem Angela i Hodgins wynajmują prywatnego detektywa, aby odnalazł męża dziewczyny.
Brennan i Booth starają się rozwikłać sprawę śmierci matki młodej piłkarki. Kobieta zginęła kiedy jej auto w czasie odpalania silnika wybuchło. W sprawie wszystkich zastanawia fakt, że zamordowana była zwyczajną kurą domową. Z czasem na jaw wychodzi, że kobieta działała w latach siedemdziesiątych w radykalnej organizacji – Narodowej Armii Wolności, była także poszukiwana przez FBI w związku z morderstwem. Tymczasem Brennan odwiedza ojca w więzieniu.
Grupa śledcza bada sprawę kolejnego morderstwa. Tym razem w lesie odnalezione zostały rozkładające się zwłoki. Sprawa jest tym ciekawsza, że ciało pozbawiono rąk i nóg.
Booth i Brennan oglądają rozkładające się ciało, odnalezione przez nastoletnią parę. Ofiarą okazuje się być Franklin Curtis, zajmujący się dotychczas organiczną żywnością. Ciało mężczyzny zostało ugotowane. Booth i Brennan przesłuchują ludzi z farmy Curtisa. Wkrótce zostaje odnaleziona kolejna ofiara. Tymczasem Booth i Brennan zaczynają chodzić na terapię partnerską.
Podczas imprezy z okazji Halloween zostają odnalezione zmumifikowane zwłoki młodej dziewczyny. Booth i Brennan prowadzą śledztwo, z którego wynika, iż ofiara nie żyje od blisko roku. Wszystko to dodaje sprawie dodatkowego dramatyzmu. Z czasem znalezione zostaje kolejne ciało, ukrywane od prawie dwóch lat. Booth i Brennan muszą zapobiec kolejnej zbrodni.
Ku zaskoczeniu wszystkich, w piecu instytutu znalezione zostają szczątki ludzkie. Pierwsze podejrzenia padają na pracowników Jeffersonian. Motywem miałby być projekt prowadzony przez ofiarę, a dotyczący artefaktów Gormogona. Z czasem na jaw wychodzą skomplikowane relacje uczuciowe pracowników instytutu. Tymczasem Booth jest zmuszony udawać chłopaka Cam podczas rodzinnego obiadu.
Po dwudziestu latach zostaje wyciągnięta kapsuła czasu, którą zakopano w 1987 roku. Ku zaskoczeniu wszystkich, wewnątrz kapsuły znajdują się zwłoki. Booth i Brennan w trakcie śledztwa odkrywają, że ofiara była szkolnym outsiderem. Badając sprawę zespół musi cofnąć się w czasie i odnaleźć mordercę pośród absolwentów.
Policja bada sprawę odnalezienia ciała arcybiskupa, zespół przeprowadza wnikliwą analizę ciała zmarłego. Okazuje się, że rzepki zostały z chirurgiczną precyzją usunięte z kolan ofiary. Wszystko wskazuje na powrót Gormogona.
Booth i Brennan prowadzą sprawę zamordowanego Krisa Kringle, świętego Mikołaja. Martwy mężczyzna został znaleziony przez dwa świąteczne elfy. W toku śledztwa ofiara coraz bardziej przypomina prawdziwego świętego Mikołaja. Tymczasem Bones stara się zorganizować rodzinne święta ojcu i bratu w więzieniu. Prokurator Caroline wyraża zgodę, pod warunkiem, że Booth pocałuje pod jemiołą Brennana.
W błotnistym zbiorniku Homestead Natural Hot Springs odkryte zostaje ciało. Booth i Brennan badają sprawę i odkrywają, że ofiarą był Tripp Goddard. Mężczyzna był przystojnym motocyklistą i zmarł około dwa tygodnie wcześniej po jednym z wyścigów. Tymczasem pojawia się dziewczyna Sweetsa.
Zespół stara się zidentyfikować szczątki młodego sportowca. Po określeniu personaliów zamordowanego, Booth i Bones wybierają się na rozmowę do siostry ofiary. Andela i Hodgins odbywają poważną rozmowę. Zack postanawia skupić całą swoją energię i czas na rekonstrukcji połamanego szkieletu.
Na skutek wypadku ginie prowadząca samochód młoda kobieta. Dziecko wraz z którym jechała autem przeżywa. Booth i Brennan wyruszają do rodzinnego miasta dziewczyny, aby dowiedzieć się kto jest winny jej śmierci. Bones postanawia korzystając z pomocy Bootha zająć się dzieckiem, do czasu, aż sprawa zostanie wyjaśniona.
Ojciec Brennan, Max Keenan staje przed sądem, oskarżony o zamordowanie dyrektora FBI, Kirby’ego. Prawie cały zespół badawczy zostaje wezwany w charakterze świadków oskarżenia. Prokurator nie wzywa jedynie Brennan, która chce wesprzeć ojca. Kobieta zamierza wykorzystać wszystkie możliwe sposoby, aby pomóc obronie zebrać materiał dowodowy.
Tommy Sour, który marzył o karierze piosenkarskiej, zostaje odnaleziony martwy. W toku śledztwa, Bootha i Brennan trafiają do Checker Box Restaurant, gdzie zwykł był śpiewać zamordowany. Z czasem pojawia się kilku podejrzanych. Tymczasem Bones prezentuje przed współpracownikami swoje umiejętności wokalne, niestety występ zostaje przerwany przez makabryczne wydarzenie. Szalona kobieta, która jest zakochana w Boothie, oddaje strzał do Brennan. Booth ratuje życie Bones, jednak kula trafia w jego klatkę piersiową.
W mieście ponownie pojawia się Gormogon, seryjny zabójca. Tymczasem z instytutu znika srebrny sztylet. Podejrzenie pada na pracowników instytutu. Spekuluje się, iż ktoś z zatrudnionych prawdopodobnie współpracuje z Gormogonem.
Brennan bierze udział w dochodzeniu po wypadku kolejowym. Na miejscu katastrofy odnalezione zostają ciała ofiar, w tym jedno należące do amerykańskiego senatora Paula Davisa. Zwłoki polityka znajdowały się w samochodzie, który zaparkowany został na torach. Tymczasem Bones stara się odnaleźć swego ojca. W Instytucie rozpoczyna pracę nowy szef, doktor Camille Saroyan.
Booth i Brennan badają znalezione w zatoce Delaware szczątki matki oraz jej nienarodzonego dziecka. Kobieta jest młodą mężatką, która zaginęła rok wcześniej w tajemniczych okolicznościach. Pierwszym podejrzanym o morderstwo jest mąż kobiety. Ten jednak znika, zanim udaje się go przesłuchać. Booth jest zdołowany, ponieważ jego była dziewczyna pozwala ich synowi spędzać czas ze swoim nowym chłopakiem.
Zwłoki zaginionego przed trzema tygodniami chłopaka, Dylana Crana zostają odnalezione w śmieciarce. W trakcie dochodzenia, okazuje się, że główną podejrzaną jest przygarnięta przez rodzinę zastępczą siedemnastoletnia dziewczyna, Kelly. Tymczasem konflikt pomiędzy Bones i Cam nasila się.
Po tym jak wykopane zostają szczątki młodej dziewczyny, zespół Booth i Bones uznaje za oczywiste, że nie padła ona ofiarą przypadkowego mordercy. Podczas dokładnej analizy laboratoryjnej, potwierdza się, iż prawdopodobnie mają do czynienia z seryjnym zabójcą. Z czasem zostaje odnalezione kolejne ciało. Bones i jej zespół muszą rozwiązać sprawę, zanim ucierpią kolejne kobiety.
Bones i Booth prowadzą dochodzenie w sprawie zwłok znalezionych w wannie z chemikaliami. Rozłożone ciało jest trudne do zidentyfikowane. W trakcie śledztwa krąg podejrzanych zacieśnia się do dwóch osób. Z czasem okazuje się, że zamordowany mężczyzna miał dwie żony i dziewczynę. Tymczasem zespół zastanawia się nad uczuciami Bootha do Rebecci, która odrzuciła jego propozycję małżeńską.
W wyniku eksplozji w hotelu, giną ludzie, w tym kilku uczestników międzynarodowej konwencji do spraw zwalczania zorganizowanego handlu narkotykami. Pośród zmarłych są między innymi ksiądz, prokurator ekwadorski, a także kelnerka Lisa Winnaker, która jak się okazało została zgwałcona i zamordowana jeszcze przed wybuchem. Dziewczyna była umówiona z synem Dolores Ramos, kolumbijskiego sędziego, którego chroni immunitet dyplomatyczny.
Zespół stara się rozwikłać sprawę śmierci dziewięcioletniej małej miss piękności. W trakcie śledztwa podejrzenia padają na rodziców uczestniczek konkursu piękności. Breennan udaje się na zajęcia taneczne dla dziewczynek, licząc że tam znajdzie zabójcę. Wizyta na lekcji okazuje się jednak błędem. Hodgins i Angela idą na wyjątkowo udaną randkę.
Na pustyni w okolicy Las Vegas odnalezione zostają szczątki prokuratora federalnego, który zaginął pięć lat wcześniej. Podczas zabezpieczania okolicy i poszukiwania jakichkolwiek śladów, policja trafia także na zwłoki kobiety. Zespół badając okoliczności śmierci ofiar, dochodzi do wniosku, że zostały one zabite przez tego samego mordercę. Na zamordowanej kobiety Brennan odnajduje ślady długoletniej przemocy domowej.
Po pięciu latach od zaginięcia, znalezione zostają zwłoki dwóch nastoletnich braci bliźniaków. Booth i Breennan w prowadząc dochodzenie, uznają że zbrodnie należy przypisywać seryjnemu mordercy, Grave Diggerowi (Kopaczowi Grobów). Grave Digger zwykle porywa swoje ofiary i zanim jeszcze zażąda okupy zakopuje je. Brennan i Hodigns wkrótce stają się kolejnymi ofiarami psychopaty. Zakopani w samochodzie agenci walczą o życie.
Zespół laboratoryjny prowadzi śledztwo w sprawie śmierci studenta szkoły filmowej. Uczeń przygotował film dokumentalny na temat legendarnej bezgłowej czarownicy mieszkającej w nawiedzonym lesie przeszło trzysta lat temu. Brennan zbliża się emocjonalnie do brata ofiary.
Brennan i Booth badają miejsce zbrodni, którym jest dach siedziby FBI, gdzie odnaleziono zwęglone zwłoki mężczyzny. Przy ciele ofiary znalezione zostają dokumenty, związane ze sprawą sprzed trzydziestu laty, w którą zaangażowany był ojciec Bones. Russ mówi Bones, że ojciec z którym utrzymuje kontakt, ostrzega ich przed niebezpieczeństwem. Dochodzenie ujawnia, że na dachu zginął zamachowiec starający się zamordować Russa. Wiele szokujących faktów wychodzi na jaw. Tymczasem Zack broni pracę doktorską.
Booth i Brennan muszą zidentyfikować szczątki, odnalezione w celi seryjnego mordercy Howarda Eppsa. Podczas badania zwłok, ku zdziwieniu lekarzy, okazuje się, że szczątki nie należą do Eppsa. Oznacza to, że morderca zbiegł i należy rozpocząć akcje pościgową. Tymczasem rządny zemsty Howard postanawia zemścić się i chce w tym celu wykorzystać syna Boohta. Cam wdycha śmiertelne toksyny podczas przeprowadzania autopsji.
Brennan zostaje przydzielony do współpracy nowy agent Sullivan. Booth ma wolne, ponieważ spotyka się z terapeutą. Bones wraz z nowym partnerem bada szczątki ludzkie odnalezione w żołądku aligatora. Tymczasem Sully zaprasza panią doktor na randkę.
Booth i Brennan prowadzą śledztwo w sprawie zabójstwa Terenca Bancrofta którego znaleziono martwego we własnym domu. Bancroft był jednym z biznesmenów finansujących Instytut Jeffersona. Hodgins naraża reputację całego instytutu, usuwając dowod, który łączy go z ofiarą. Brennan jest zmuszony do podjęcia ważnej decyzji związanej z przyszłością zespołu.
Brennan i Booth mają prowadzić śledztwo w sprawie śmierci, które bardzo przypominają zbrodnie opisywane w książce napisanej przez Bones. Pierwsza ofiara ginie w porcie, kolejna zostaje znaleziona w sklepie zoologicznym. Dochodzenie wykazuje, że obie ofiary zostały zastrzelone z tej samej broni. Sully nalega, aby wykorzystać jego doświadczenie profilera w prowadzeniu śledztwa.
Zespół prowadzi dochodzenie w sprawie morderstwa młodej Azjatki odnalezionej w strumieniu. Z ciała kobiety usunięto wszystkie kości. Bones kontynuuje swoje wakacje, których myślą przewodnią jest brak kości. Tymczasem Sully rozważa zamieszkanie na stałe z Bones.
Woda zalewa stary cmentarz, w wyniku czego wiele trumien wypływa. Brennan decyduje się pomóc w identyfikacji szczątek, aby ponownie pochować zmarłych. Na cmentarzu nikogo nie chowano od blisko pięćdziesięciu lat, jednak wśród zwłok Bones odnajduje ciało zakopane około pięć lat temu. Booth wybiera się z Brennan do psychologa, aby naprawić wzajemne relacje. Związek Angeli i Hodgingsa rozwija się, jednak ten ostatni popełnia błąd.
Booth i Brennan badają szkielet odnaleziony w betonie. Booth uważa, że okoliczności zabójstwa wskazują na mafię. Zespół podejrzewa, że w morderstwo zamieszany jest Hugh Kennedy jednak okazuje się, że ten prawdopodobnie spłonął w samochodzie. Dochodzenie komplikuje się coraz bardziej.
Zwłoki niezidentyfikowanego mężczyzny zostają odnalezione w kraterze. Szczątki są zmiażdżone w wyniku upadku z dużej wysokości bez spadochronu. Brennan i Booth próbują ustalić tożsamość odnalezionego. Hodgins snuje liczne teorie dotyczące życia pozaziemskiego, kiedy w wyniku analizy okazuje się, że ciało przebywało w przestrzeni kosmicznej przez dłuższy czas. Z czasem wychodzi na jaw, że zamordowany mężczyzna był astronautą.
W starym kamiennym domku zostają odnalezione świecące kości. Brennan i Booth zjawiają się na miejscu, aby zbadać sprawę. Zespół przeprowadza test na skażenie radioaktywne i przesyła kości do Instytutu. Śledczym udaje się zidentyfikować ofiarę, jednak nie potrafi wyjaśnić zjawiska zielonej poświaty. Cały zespół uczestniczy w badaniach, każdy bada szczątki pod kontem własnej specjalizacji.
W wózku sklepowym zostaje odnaleziony szkielet młodej dziewczyny. W wyniku rekonstrukcji kości twarzy, lekarze dochodzą do szokującego wniosku, że kobieta wyglądała na osiemdziesięcioletnią staruszkę. Booth i Bones starają się odszukać osoby, która mogła mieć motyw do popełnienia zbrodni. Tymczasem Max Kennan, ojciec Bones wyjawia informacje dotyczące jej przeszłości. Angela i Hodgins postanawiają się pobrać.
Doktor Temperance Brennan, antropolożka wraca z Gwatemali, gdzie zajmowała się identyfikacją ofiar ludobójstwa. Zostaje zatrzymana na lotnisku, gdzie odbywa rozmowę z agentem FBI. Feneralne Biuro Śledcze prosi specjalistkę o pomoc przy prowadzonym śledztwie. Współpraca zespołu laboratoryjnego bardzo szybko daje doskonałe wyniki. Udaje się zidentyfikować znalezione zwłoki, a z czasem i sprawcę zbrodni.
Pod jedną z waszyngtońskich kawiarni eksploduje auto pułapka. Poza kierowcą, za sprawą wybuchu ginie czterech przypadkowych przechodniów. Agenci szybko ustalają, że SUV z bombą należał do Hamida Marsuka, dyplomaty pochodzącego z Bliskiego Wschodu. Doktor Brennan bada szczątki ofiar wypadku. Istnieje podejrzenie, że był to samobójczy zamach przeprowadzony przez Marsuka. W toku śledztwa wychodzi na jaw, iż właściciel samochodu prawdopodobnie nie był sprawcą, a ofiarą wypadku.
Doktor Brennan współpracuje z agentem FBI Boothem przy kolejnej sprawie. Para bada okoliczności tajemniczej śmierci studenta elitarnej szkoły. Udaje się ustalić tożsamość chłopaka, okazuje się, że był to syn ambasadora Wenezueli. Pomimo sprzeciwu szkoły i rodziców, stróże prawa rozpoczynają przesłuchania wśród uczniów, którzy mogą być zamieszani w zbrodnię. Wychodzi na jaw, że najbliżsi znajomi zmarłego starają się przemilczeć wiele spraw.
Strażnik leśny wraz z weterynarzem, odnajdują zwłoki niedźwiedzia, który niedawno połknął ludzką rękę. Kończyna zostaje przesłana do analizy, której dokonać ma instytut doktor Brennan. Badanie wykazuje, że ręka została odcięta człowiekowi zanim niedźwiedź ją znalazł. Booth i Brennan ruszają wspólnie do stanu Waszyngton, aby tam przeprowadzić wnikliwe śledztwo. Z czasem okazuje się, że poszukują mordercy - kanibala.
Booth prosi doktor Brennan o pomoc w identyfikacji zwłok sześcioletniego chłopca znalezionego w okolicy centrum handlowego. Pani doktor i jej zespół, szybko ustalają, że ciało należy do zaginionego niedawno Charliego Sandersa. W trakcie oględzin okazuje się, że chłopiec został zgwałcony. Z czasem wychodzi na jaw, że okoliczności zaginięcia nie są takie, jak pierwotnie ustalono. Tymczasem w Jeffersonian Institute trwają przygotowania do imprezy dla sponsorów, na której obowiązkowo mają być obecni wszyscy pracownicy.
Angela namawia doktor Brennan na wyjście do klubu hiphopowego. Niechętna Temperance z czasem ulega. Podczas wizyty w nocnym klubie, źle zrozumiana wypowiedź pani doktor, prowadzi do bójki w trakcie której, jeden z uczestników wpada na ścianę i przebija ją na wylot. W zdewastowanej ścianie znajdują się zmumifikowane zwłoki z torbą metamfetaminy na klatce piersiowej. Pod wpływem uderzenie, narkotyk przedostaje się do sali i odurza wszystkich klubowiczów. Booth bada okoliczności zajścia.
Przebywający w celi śmierci Howard Epps, utrzymuje, że jest niewinny. Potwierdza to jego adwokat. Aresztowany przez Bootha skazaniec, został oskarżony o zamordowanie siedemnastoletniej dziewczyny. Agent Booth na 30 godzin przed egzekucją, decyduje się uspokoić sumienie i ponownie zbadać wszystkie okoliczności sprawy. Z pomocą federalnemu przychodzi doktor Brennan i jej zespół.
Z wizytą do Brennan przybywa jej były chłopak Stires. Była para planuje wspólne wyjście na kolację, plany komplikuje Booth, który pojawia się w laboratorium z ubrudzoną ziemią lodówką, w której znajdują się ludzkie zwłoki. Zespół w trakcie śledztwa ustala, że jest to dwudziestoletnia dziewczyna, Maggie, porwana blisko rok wcześniej dla okupu. Dziewczyna była uzależniona od narkotyków. W sprawę zamieszana jest Mary Costello. W domu Costellów, agent Booth spostrzega nową lodówkę oraz obciążające ślady.
Angela namawia Brennan na firmowe przyjęcie gwiazdkowe. Tymczasem Booth pojawia się z kolejnym zadaniem dla zespołu. W starym schronie atomowym odnalezione zostaje ciało mężczyzny, który zmarł wiele lat wcześniej. Lekarze wykluczają samobójstwo, ponieważ w kieszeni zmarłego znajdują dwa bilety w jedną stronę do Paryża. Tymczasem Zack i Hodgins postanawiają doprawić świąteczny poncz alkoholem.
Nowa książka Brennan staje się bestsellerem, kobieta udziela wywiadu w telewizji. Jej chłodne, naukowe podejście nie przysparza jej wielu fanów. Tymczasem w spalonym samochodzie znalezione zostają zwłoki kobiety oraz dziecięcy but. Booth próbuje ustalić, czy na miejscu doszło do porwania dziecka. Angela pracuje nad stworzeniem wirtualnej rekonstrukcji twarzy kobiety, dzięki czemu udaje się ustalić jej tożsamość. Zwłoki należą do Poliny Rozaliny Semov, imigrantki, która poślubiła w Stanach Carla Deckera.
Brennan i Booth wyruszają razem do Los Angeles zbadać sprawę morderstwa pewnej call-girl. Ofiara przeszła liczne operacje plastyczne. Doktor Brennan liczy na to, że uda jej się spotkać z hollywoodzkim producentem, który jest zainteresowany nakręceniem filmu na podstawie jej książki. Tymczasem w instytucie dochodzi do konfliktu między Goodmanem i Hodginsem.
Brennan i Booth prowadzą wspólne śledztwo w sprawie pochodzenia rozkładającego się ciała, które znaleziono ubrane w niecodzienny kostium w jednej z uliczek. W trakcie dochodzenia, zespół odkrywa, że nastolatek, którego szczątki znaleziono, prawdopodobnie prowadził podwójne życie. Booth i Brennan dowiadują się, że Warren napisał komiks i stworzył własnego bohatera.
Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie zwłok odnalezionych w bagażniku samochodu członka gangu. W czasie przesłuchania mężczyzny nadjeżdża kolejne auto i wybucha strzelanina. Podejrzanemu udaje się zbiec. Booth i Brennan podążają za wskazówkami, które doprowadzają ich do pustego grobu oraz do domu senatora, gdzie pracował członek gangu.
Brennan i Zack przeszukują miejsce w którym rozbił się samolot z chińskimi dyplomatami i kobietą na pokładzie. Na miejscu zdarzenia Brennan znajduje fragmenty kości, które nie należą do żadnego z pasażerów. Okazuje się, że są to szczątki człowieka, który zginął pięć lat wcześniej. Doktor Goodman oczekuje od zespołu jedynie zbadania okoliczności śmierci dyplomatów. Jednak pani doktor, postanawia rozwiązać obie sprawy jednocześnie.
Brennan umawia się na randkę przez Internet, jednocześnie pani doktor dostaje pilne zlecenie. W zatoce Chesapeake znalezione zostają zwłoki zastrzelonego mężczyzny. FBI stara się dociec, czy jest to James Cugini, mafioso, który zaginął sześć lat wcześniej. Booth bada jrównież sprawę odnalezionych w magazynie zwłok przywiązanych do łóżka. Wszystko wskazuje na to, że przed śmiercią, ciało zostało okrutnie okaleczone. Podczas randki ktoś strzela do Brennan.
Bones i Booth znajdują w szybie wentylacyjnym szczątki kobiety, która kręciła filmy dokumentalne. Zespół dowodzony przez Brennan i Booth schodzi do świata, który bezdomni stworzyli sobie w tunelach. Zespół bada okoliczności śmierci dwudziestoczteroletniej Marti Hunter. Agenci aresztują byłego żołnierza, u którego znajdują aparat Marti oraz zakrwawione ubrania.
Angela Montenegro w trakcie wakacji na pustyni Navajo, zwraca się do doktor Brennan z prośbą o pomoc. Angela odnajduje czaszkę i obawia się, że należała ona do jej wieloletniego chłopaka korespondencyjnego Krika Persingera. Mężczyzna jakiś czas temu zaginął z miejscową przewodniczką. Doktor Brennan nieoficjalnie zajmuje się śledztwem.
Zwłoki Teda Macys zostają znalezione na wyspie Assateague w pobliżu Parku Narodowego, gdzie prawdopodobnie ukryty został skarb Blackbeard. Booth i Brennan prowadzą dochodzenie w sprawie 300-letniej kości palca. Zespół jednocześnie dowiaduje się więcej o miejscu, gdzie mógł zostać ukryty skarb piratów. Hodgins jest podekscytowany faktem, że opuszcza laboratorium, aby pomóc w sprawie.
Doktor Brennan postanawia spędzić swój urlop pomagając w Nowym Orleanie identyfikować ofiary huraganu Katarina. Nie wiadomo jak i dlaczego, kobieta budzi się w hotelu, obita i zakrwawiona, nie pamiętając co się stało. Booth przyjeżdża, by pomóc ustalić przebieg wydarzeń. Tymczasem miejscowa policja odnajduje martwego eksperta medycznego, wówczas Brennan staje się główną podejrzaną. Śledztwo prowadzi w świat voodoo.
Ekipa pomaga córce szefa Bootha, Sama Cullena – Amy. U kobiety wykryto raka po przeszczepie fragmentu kości. Booth i Brennan odkrywają, że Amy nie jest jedyną ofiarą, która cierpi na powikłania nowotworowe po przeszczepie. Dochodzenie wykazuje, że stało się tak za sprawą rażących zaniedbań lekarskich.
Brennan i Booth prowadzą śledztwo w sprawie zabójstwa na cmentarzu Arlington. W rocznicę śmierci Charliego Kenta, żołnierza zabitego w Iraku, znaleziono na jego grobie zwęglone zwłoki. Wszyscy podejrzewają, że był to akt samospalenia w proteście przeciwko wojnie, jednak Brennan wątpi w wersję samobójstwa. Tymczasem Booth wspomina swoją ciemną przeszłość jako snajpera w wojsku oraz horror wojny.
Instytut prowadzi badania w związku z odnalezieniem szczątków niezidentyfikowanej kobiety. Zespół przygotowuje rekonstrukcje twarzy na podstawie czaszki. Kiedy doktor Brennan widzi przygotowaną przez Angelę twarz zmarłej, natychmiast każe przenieść zwłoki i wszystkie jej rzeczy do swojego gabinetu. Wśród znalezionych przedmiotów lekarka odnajduje klamrę w kształcie delfina, która należał do jej zmarłej matki.
