W ostatnich dniach drugiej wojny światowej naziści wykorzystują czarną magię, chcąc powołać do życia demona, który pomoże im uniknąć nadchodzącej klęski. Przejęty przez oddział aliantów Hellboy zostaje wychowany przez amerykańskiego profesora, żeby przy zachowaniu najgłębszej tajemnicy wspierać służby specjalne w walce z siłami zła.